针对您提出的“工伤后医院只能开三个月请假条怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，医院开具病假证明的时间长度是有明确规定的，这通常基于患者的实际病情和医疗需要。根据相关规定，门急诊病假证明中，急诊病人休假时间一般不超过5天，日间门诊病人休假时间不超过7天，而门诊特殊病人（如慢性病、骨折等）可酌情延长，但休假时间一次通常不超过30天。住院病假证明方面，患者出院时根据病情需要继续病休的，一般休假时间不超过30天，特殊病人不超过60天。对于严重影响日常生活或生活不能自理的疾病，如重大手术、晚期癌症等，病假时间可酌情延长，但也有相应的上限。
针对您的情况，如果医院已经根据您的实际病情开具了三个月的请假条，这通常是在特殊情况下，医生根据您的具体病情和康复需要做出的专业判断。然而，如果医院在开具病假证明时存在不符合规定的情况，或者您认为病假时间需要进一步延长，您可以采取以下措施：
与医生沟通：首先，您可以与开具病假证明的医生进行沟通，说明您的实际病情和康复需要，看是否可以调整病假时间。医生会根据您的具体情况和医疗需要，重新评估并给出更合适的病假建议。
咨询医院管理部门：如果与医生沟通后问题仍未得到解决，您可以向医院的管理部门（如医务科或门诊部）咨询，了解医院关于病假证明开具的具体规定和流程，以及是否存在特殊情况下的延长病假时间的可能性。
申请劳动能力鉴定：如果您的工伤情况较为严重，且病假时间需要进一步延长，您可以考虑向当地的劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定。鉴定委员会会根据您的工伤情况和康复需要，给出更专业的评估和建议，这可能包括延长病假时间或调整工作安排等。
了解工伤保险政策：同时，您也可以了解当地的工伤保险政策，看是否可以获得相关的医疗和康复支持，以及病假期间的工资福利等保障。这有助于您更好地维护自己的合法权益。
最后，需要强调的是，病假证明是具有法律效力的重要医学文书，医生在开具时必须严格遵守相关规定和流程。如果您认为医院在开具病假证明时存在违规行为，您可以向相关部门进行投诉或举报。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。