公司能否因员工身体原因辞退员工，需根据具体情况及法律规定来判断，不能一概而论地说违法或不违法。以下从不同情况为你详细分析：
医疗期内的保护规定
- 法律依据：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业员工因患病或非因工负伤需要停止工作治疗的，根据工作年限给予3个月至24个月的医疗期。
- 保护措施：在医疗期内，公司不得以员工生病无法工作为由解除劳动合同。例如，员工小李工作5年后因病需治疗，享有6个月医疗期，在这6个月内，公司不能因为小李生病不能工作就辞退他。
医疗期届满后的处理
- 可以正常工作的情况：
- 若员工医疗期结束后身体恢复，能胜任原工作或公司另行安排的工作，公司不得辞退。如小张医疗期后康复并能胜任原工作，公司应允许其继续工作，若此时公司辞退小张，就属于违法解除劳动合同。
- 不能从事原工作也不能从事另行安排工作的情况：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》，若员工医疗期满后不能从事原工作，也不能从事公司另行安排的工作，公司可提前30日书面通知或额外支付1个月工资后解除劳动合同。
- 经济补偿：解除合同时，公司需按员工在本单位工作年限支付经济补偿金，每满1年支付1个月工资，6个月以上不满1年的按1年计算，不满6个月的支付半个月工资。例如，老王工作10年后因身体原因无法胜任工作，公司可按规定支付10个月工资作为经济补偿金后解除劳动合同。计算公式为：经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（工作年限按上述规则折算）。
特殊疾病的处理
对于职业病或工伤等特殊疾病，即使员工无法再从事原工作，公司也不能轻易辞退。员工应享受相应的工伤待遇或职业病待遇，公司需按相关规定安排合适岗位或给予补偿。比如，员工因工作原因患上职业病，公司不能因为其身体原因不能从事原工作就直接辞退，而应该根据职业病的相关规定进行处理。
公司有权辞退的其他情形
除身体原因外，公司在以下情况下也有权辞退员工：劳动者存在过错（如严重违反规章制度、被追究刑事责任等）；劳动者无过错但出现法定情形（如不能胜任工作经培训或调整仍不能胜任）；经济性裁员情形（如企业破产重整、生产经营严重困难等）。不过这些情况与员工身体原因辞退的逻辑不同，但也是公司辞退员工的合法依据。
因身体原因辞退的赔偿问题
- 合法辞退：公司按法定程序辞退因身体原因无法工作的员工时，需支付经济补偿金，计算方式如上述医疗期届满后不能从事工作的情况。
- 违法辞退：若员工身体原因不影响工作或公司未履行合法解除程序而辞退员工，属于违法解除劳动合同，公司需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。例如，员工医疗期内公司强行辞退，或者医疗期届满后，员工还能从事另行安排的工作，公司却辞退员工，都属于违法辞退，赔偿金 = 2 × 经济补偿金。
员工权益保障
员工面对因身体原因被辞退时，应了解自己的权益并依法维护。可通过向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等法律途径维权。比如，员工认为自己被违法辞退，就可以收集相关证据，向当地的劳动仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付赔偿金等。
如果你有具体的身体原因辞退情况，比如涉及某种特殊疾病、特定的医疗期时长等，都可以直接向我咨询，我会为你进一步分析解答。