发票金额小于付款金额是否违法，这并非一个简单的是非问题，而是需要结合具体的交易背景、目的以及后续处理情况来综合判断。

首先，我们要明确的是，在正常的商业交易中，发票金额与实际付款金额之间确实可能存在合理差异。比如，商家为了鼓励消费者及时付款或促进销售，可能会给予一定的现金折扣。在这种情况下，消费者按折扣后的金额付款，而发票上开具的则是实际交易金额（即折扣前的原价）。这种做法是符合商业习惯和财务规范的，并不构成违法。再比如，在分期付款或预付定金的交易中，双方可能会先约定支付部分款项并开具对应金额的发票，待后续完成全部交易或服务后再补齐剩余金额的发票。只要后续操作按照约定进行，这种安排也是合法的。

然而，如果发票金额小于付款金额的行为背后隐藏着其他目的，比如偷逃税款、商业贿赂或不正当利益输送等，那么这种行为就可能触犯法律。具体来说：

1. 偷逃税款：如果故意通过少开发票金额来减少应纳税额，这种行为就违反了《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定。税务机关有权追缴不缴或少缴的税款，并处以罚款；如果构成犯罪，还将依法追究刑事责任。

2. 商业贿赂或不正当利益输送：当付款金额大于发票金额时，这种差价有可能被用于商业贿赂或不正当利益输送。这种行为违反了《中华人民共和国反不正当竞争法》和《中华人民共和国刑法》等相关法律法规关于商业贿赂的规定。

3. 虚开发票：根据《中华人民共和国发票管理办法》，发票的开具应当与实际交易金额相符。如果发票金额小于实际付款金额且没有合理解释，就可能构成虚开发票的行为。这种行为将面临法律的制裁，包括没收违法所得、罚款以及可能的刑事责任。

为了避免这些潜在的法律风险，企业和个人在进行交易时应严格遵守相关法律法规，并采取以下措施：

• 加强财务管理和内部控制：确保发票的真实性和合法性，不得随意变更品名和金额。
• 及时沟通补开发票：当发现发票金额小于实际付款金额时，应立即与供应商或服务提供商沟通，要求补开差额部分的发票。
• 调整账目与注释说明：如果无法获得补开的发票，应调整账目，并在财务报表中进行必要的注释和说明，以确保账目的清晰和准确。

综上所述，发票金额小于付款金额并不总是违法的，但其合法性确实需要结合具体交易背景和后续处理情况来判断。因此，在进行交易时，请务必保持谨慎和合规，以避免不必要的法律风险。