事业单位上班超过八小时是否合法，需分情况讨论：

1. 标准工时制下的合法性分析

根据《劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。若事业单位与劳动者签订的劳动合同中明确约定每日工作八小时，且未通过民主程序制定加班制度或未与劳动者协商一致延长工作时间，则要求劳动者每日工作超过八小时属于违法行为。此时，劳动者有权拒绝超时加班，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁主张加班费及补偿。

1. 特殊工时制下的合法性分析

若事业单位因生产特点或工作性质需实行不定时工作制或综合计算工时工作制，需经劳动行政部门批准。例如，教师因教学任务需在课余时间备课、批改作业，或医护人员因排班需连续工作超过八小时，若已依法获批特殊工时制，则超时工作不构成违法。但需注意，即使实行特殊工时制，事业单位仍需保障劳动者休息权，例如通过调休、补休或支付加班费等方式补偿超时劳动。

1. 加班的法定限制与例外情形

根据《劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要安排加班的，需与工会和劳动者协商一致，且每日不得超过一小时（特殊原因下不得超过三小时，每月累计不得超过三十六小时）。若事业单位未经协商单方面强制加班，或加班时长超过法定限制，则属于违法行为。但需注意，《劳动法》第四十二条规定的例外情形（如发生自然灾害、事故威胁生命财产安全等紧急情况）不受上述限制。

1. 事业单位的特殊性考量

事业单位作为公法人，其用工管理需同时遵守《劳动法》《劳动合同法》及《事业单位人事管理条例》等规定。若事业单位与劳动者建立的是人事关系（如编制内人员），则加班争议可能适用《事业单位人事管理条例》中关于工时、休假的规定；若建立的是劳动关系（如合同制员工），则直接适用《劳动法》相关规定。实践中，部分事业单位可能通过内部规章制度规范加班管理，但此类制度需经民主程序制定并公示，否则对劳动者不产生约束力。

法律建议：

• 若您作为事业单位劳动者被要求超时加班，建议首先核查劳动合同约定的工时制度及单位是否依法获批特殊工时制；
• 保留加班证据（如考勤记录、加班通知、工作成果等），通过单位内部投诉渠道或劳动监察部门主张权益；
• 若单位拒不改正，可申请劳动仲裁要求支付加班费、经济补偿或解除劳动合同并主张赔偿金。

温馨提示：劳动法律问题具有较强个体差异性，具体案件需结合证据材料分析。若您面临相关纠纷，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供专业法律意见。