结论：合同约定仲裁的情况下，一般不能直接起诉，但存在仲裁协议无效或仲裁裁决被撤销、不予执行等特殊情况时，当事人可以向法院提起诉讼。

一、合同约定仲裁的一般原则

在合同纠纷中，若双方已在合同中明确约定了仲裁条款，那么一般情况下，当事人应直接按照仲裁协议将争议提交给约定的仲裁机构进行裁决，而不能直接向法院提起诉讼。这是因为仲裁和诉讼是两种相互独立的、排斥的争议解决方式，一旦选择了仲裁，即意味着双方放弃了通过诉讼解决争议的权利。

二、可以直接起诉的特殊情况

1. 仲裁协议无效

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，若仲裁协议存在以下情形之一，将被认定为无效：

     • 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围；
     • 无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议；
     • 一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议；
     • 仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确，且当事人无法达成补充协议的。

   • 当仲裁协议被认定无效时，当事人有权向有管辖权的法院提起诉讼，以解决争议。

2. 仲裁裁决被撤销或不予执行

   • 仲裁裁决作出后，如果当事人有证据证明该裁决存在法定可撤销或不予执行的情形（如没有仲裁协议、裁决的事项不属于仲裁协议的范围或仲裁委员会无权仲裁、仲裁庭的组成或仲裁程序违反法定程序等），可以向法院申请撤销仲裁裁决或申请不予执行仲裁裁决。
   • 若仲裁裁决被法院撤销或不予执行，当事人可以就该纠纷向法院提起诉讼，以寻求司法救济。

三、仲裁条款约定不明的情况

• 当合同中的仲裁条款约定不明时，如仅约定了发生争议由仲裁解决，但未明确具体的仲裁委员会，且事后双方又无法就选定的仲裁委员会达成一致意见时，该仲裁条款无效。此时，当事人可以直接向有管辖权的人民法院提起诉讼。
• 如果合同中的仲裁条款未约定仲裁机构，或约定的仲裁机构名称不准确、无法确定具体的仲裁机构，或者约定了由某地的仲裁机构仲裁但该地有多个仲裁机构的，同样会被认定为无效仲裁协议。在这种情况下，当事人也可以选择通过诉讼方式解决争议。

四、实务操作建议

1. 审查仲裁协议有效性：在签订合同时，务必明确仲裁机构和仲裁事项，以避免后续可能出现的纠纷。在发生纠纷时，应首先审查仲裁协议的有效性，确认是否存在无效情形。
2. 遵守程序要求：存在有效仲裁协议时，应及时向选定的仲裁委员会提交申请，并严格按照仲裁程序进行。若仲裁协议无效或存在其他特殊情况，再考虑向法院提起诉讼。
3. 关注时效问题：无论是仲裁还是诉讼，都存在时效问题。当事人应在法定时效内提起仲裁或诉讼，以免丧失胜诉权。

示例说明：假设甲公司与乙公司签订了一份买卖合同，并在合同中明确约定了仲裁条款。后来，双方因合同履行发生纠纷。若仲裁条款有效且明确约定了仲裁机构，甲公司应直接向该仲裁机构申请仲裁，而不能直接向法院起诉。然而，如果仲裁条款因未明确约定仲裁机构而被认定无效，甲公司则有权向有管辖权的法院提起诉讼。

最后提醒：在处理合同纠纷时，应充分了解并遵循相关法律法规及仲裁协议的具体规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。