若银行合并后您在该银行的存款超过50万，一般情况下不会直接涉及“赔偿”问题，而是根据存款保险制度以及合并的具体安排来保障您的存款安全，具体如下：

1. 存款保险制度的保障：

   • 根据我国《存款保险条例》，存款保险实行限额偿付，最高偿付限额为人民币50万元。但这一规定主要适用于银行破产等极端情况。在银行合并的情形下，并不直接触发存款保险的赔付机制。
   • 合并后的银行将承接原银行的债权债务关系，包括您的存款。因此，您的存款在合并后仍然安全，且不受50万元限额的限制（除非合并后的银行后续发生破产等极端情况）。

2. 合并后银行的具体安排：

   • 银行合并通常会有详细的合并方案，包括如何处理客户的存款、贷款等业务。在合并过程中，银行会确保客户的权益不受损害，并会提前通知客户相关的变更事项。
   • 您可以通过关注银行发布的合并公告、通知或咨询银行客服等方式，了解合并后您的存款具体如何安排，以及是否需要您进行任何操作（如更换存折、银行卡等）。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果在合并过程中或合并后，您发现存款出现异常（如金额不符、无法取款等），应及时与银行联系并寻求解决方案。
   • 若因银行合并导致您的存款受到损失（这种情况极为罕见），且银行无法给出合理解决方案，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向银保监会投诉、提起民事诉讼等。但请注意，这通常是在银行存在过错或违法行为的情况下才适用。

给您的小建议：

• 在银行合并期间，保持与银行的沟通，及时了解合并进展和您的存款安排。
• 保留好您的存款凭证（如存折、银行卡、交易记录等），以备不时之需。
• 若对合并后的银行安排有任何疑问或不满，及时向银行反馈并寻求解决方案。