关于农业银行信用卡透支逾期利息及违约金的计算，以下是我为您提供的详细且准确的解答：

一、逾期利息的计算

1. 利率标准： 农业银行信用卡逾期利息的日利率为万分之五，即0.05%。这一利率是固定的，并且通常高于正常贷款利率，以体现对逾期还款的风险补偿。

2. 计息方式： 利息从消费入账日开始计算，直至欠款还清。农业银行采用按月计收复利的方式，这意味着每个月的利息会加入到本金中，作为下一个月计算利息的基础。具体计算公式为：利息 = 消费金额 × 0.05% × 消费入账日到实际还款日期数。

3. 实例说明： 假设您3月1日消费了2000元，账单日为每月10日，还款日为每月25日。若您3月25日未能按时还款，直到4月10日才还清，那么逾期利息就是2000元乘以0.05%再乘以41天（从3月1日到4月10日），结果是41元。

二、违约金的计算

1. 政策背景： 自2017年1月1日起，中国人民银行取消了信用卡滞纳金，改为由发卡机构与持卡人通过协议约定是否收取违约金及其收取方式和标准。

2. 收费标准： 农业银行信用卡违约金为最低还款额未还部分的5%，最低收取标准为1元人民币（或等值外币，如1美元、1欧元等）。

3. 计算公式： 违约金 = (最低还款额 - 已还款金额) × 5%。

4. 实例说明： 若您本期账单的最低还款额为500元，但最后还款日前只还款了200元，那么违约金就是(500元 - 200元)乘以5%，结果是15元。

三、注意事项

1. 信用卡类型差异： 不同类型的农业银行信用卡在具体的收费标准上可能存在差异，因此请您务必关注所持信用卡的具体条款。

2. 政策调整： 银行可能根据政策调整相关费用，建议您随时关注农业银行的官方公告或咨询客服，以了解最新的收费信息。

3. 合理规划消费和还款： 为了避免产生不必要的逾期利息和费用，我建议您合理规划消费和还款计划，确保按时足额还款。

综上所述，农业银行信用卡透支逾期利息及违约金的计算方式明确且具体。作为持卡人，您应充分了解并遵守相关规定，以确保自身权益不受损害。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时联系农业银行客服。