工程挂靠协议不受法律保护，且因违反法律法规的强制性规定，所涉合同通常无效，并会导致一系列严重的法律后果。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律对工程挂靠协议的规定
《中华人民共和国建筑法》第二十六条：
- 明确规定禁止建筑施工企业超越资质等级承揽工程，或以任何形式允许其他单位或个人使用其资质证书、营业执照承揽工程。这一规定直接针对了工程挂靠行为，表明法律对挂靠行为的明确禁止态度。
最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条：
- 明确指出没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订的建设工程施工合同无效。这一解释进一步明确了挂靠协议的法律效力，即无效。
二、合同效力分析
- 挂靠情形下签订的合同：无论是挂靠人与被挂靠人之间的内部协议，还是以被挂靠人名义与发包人签订的建设工程施工合同，均会因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效合同。这意味着，一旦挂靠行为被揭露，相关合同将无法产生法律效力，双方无法依据合同主张权利或履行义务。
三、法律后果
对建设工程质量的影响：
- 若工程质量合格，实际施工人虽可请求参照合同约定折价补偿，但这一请求需经人民法院支持，且补偿范围可能受限。
- 若工程质量不合格，且修复后仍不合格，实际施工人将无权请求折价补偿，甚至可能面临赔偿责任。
行政责任：
- 被挂靠企业可能面临责令改正、没收违法所得、罚款、停业整顿、降低资质等级乃至吊销资质证书的处罚。这些行政处罚将严重影响企业的正常运营和声誉。
- 对因挂靠导致的工程质量问题造成的损失，被挂靠企业与挂靠人需承担连带赔偿责任。这意味着，双方需共同面对因挂靠行为引发的法律后果。
民事责任：
- 因工程质量问题、拖欠材料款、劳务费等引发的纠纷，挂靠人和被挂靠人可能对第三人承担连带赔偿责任。这进一步增加了挂靠行为的风险和不确定性。
- 被挂靠人在承担责任后，虽可根据内部协议向挂靠人追偿，但由于内部协议本身可能无效，追偿范围和方式可能受限。
四、实际操作建议
避免挂靠行为：
- 建筑施工企业和个人应严格遵守法律法规，避免参与任何形式的挂靠行为。这不仅是法律的要求，也是维护市场秩序和公共安全的需要。
加强资质审查：
- 发包方在选择承包商时，应仔细审查其资质和信誉，确保工程质量和安全。这有助于减少因挂靠行为引发的纠纷和风险。
及时咨询法律意见：
- 如遇相关纠纷或疑问，应及时向我咨询具体的法律意见和帮助。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
总结来说，工程挂靠协议不受法律保护，且会导致一系列严重的法律后果。因此，在建设工程领域中应坚决杜绝挂靠等违法行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。