协议只签字不按手印，在一般情况下是有效的。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一条款明确指出了签名、盖章和按指印三种方式在法律上具有同等的效力，都是合同成立的有效方式。因此，签字本身就具有法律效力，按手印并非合同成立的必要条件。
签字的有效性
真实意思表示：签字是当事人真实意思表示的一种体现形式。只要协议内容是双方自愿协商达成的，不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方都具有相应的民事行为能力，那么即使协议上只有签字而没有手印，该协议也是有效的。
法律认可：在法律上，签字具有明确的法律效力，能够证明当事人的真实意愿。无论是商业合同还是民事协议，签字都是常见的确认方式，被法律所广泛认可。
特殊情况的考量
协议中的特别约定：在某些特殊情况下，如果当事人在协议中明确约定必须同时签字并按手印协议才生效，那么此时仅有签字而没有手印，协议可能不满足生效条件。因此，在签订协议时，应仔细阅读并理解协议中的全部条款，特别是关于生效条件的约定。
证据问题：如果发生纠纷，签字本身就可以作为重要的证据来证明协议的存在和有效性。如果对方对签字有异议，可以通过笔迹鉴定等方式来确认签字的真实性。
实际操作建议
确保协议内容合法：在签订协议时，除了签字外，还应确保协议内容真实、合法且不违反公序良俗。这是协议有效性的基础。
妥善保管协议原件：为了确保协议的法律效力和避免后续可能出现的纠纷，建议妥善保管好协议原件。在协议执行过程中，如有任何疑问或争议，应及时寻求法律帮助。
增强协议证明力：尽管签字、盖章或按手印中的任何一种方式都能使合同成立并生效，但在实际操作中，为了增强协议的可信度和证明力，建议按照法律规定和常规做法进行签署。例如，在可能的情况下，可以同时采用签字和按手印的方式。
举例说明：以甲和乙签订的二手物品买卖合同为例，双方在合同上签字确认，虽然没有按手印，但只要这份合同是双方自愿协商达成的，物品买卖也不违反法律法规，那么这份合同就是有效的，对甲和乙都具有法律约束力。
综上所述，协议只签字不按手印并不影响其有效性，但前提是必须满足协议内容真实、合法以及双方当事人具备相应民事行为能力等条件。在实际操作中，为了增强协议的可信度和证明力，建议按照法律规定和常规做法进行签署，并在必要时寻求我的法律帮助。