结论：在法律层面上，目前并没有明确的条款直接规定在商品房内存放骨灰为违法行为，但这一行为涉及多个法律与道德层面的问题，需全面分析并谨慎对待。
物权法角度：
- 商品房业主对其房屋享有占有、使用、收益和处分的权利。从这一角度看，存放骨灰理论上可以被视为对房屋的一种使用方式。
- 但，这种使用方式必须遵守相关法律法规，且不得侵犯其他业主的合法权益。例如，不得因存放骨灰而影响房屋的结构安全、卫生状况或造成其他业主的心理不适。
伦理道德与社会公德角度：
- 将骨灰存放在居住性质的商品房内，很可能与社会大众普遍接受的伦理道德观念和风俗习惯相冲突。在中国传统文化中，对于骨灰的处理有着特定的习俗和礼仪，居民楼内存放骨灰可能引发邻里关系紧张和其他业主的不满。
- 这种违背公序良俗和社会公德的行为，不仅可能影响社区和谐，还可能导致法律纠纷，如其他业主可能因此提起诉讼，要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。
小区管理规定与合同条款角度：
- 小区的管理规定或商品房买卖合同中往往包含关于房屋使用方式的限制条款。这些规定或条款可能明确禁止将房屋用于存放骨灰等特定用途。
- 因此，在考虑将商品房用于存放骨灰时，必须仔细审查相关管理规定和合同条款，以避免构成违约行为，从而面临法律责任。
法律建议：
- 鉴于可能引发的法律纠纷、社会矛盾以及违反管理规定的风险，建议谨慎对待在商品房内存放骨灰的行为。
- 在考虑这样做之前，应咨询当地相关部门或专业人士（如我，彭文静律师，专注于房产纠纷领域），了解具体的法律规定和管理要求。
- 同时，也鼓励寻找更为合适、尊重传统的方式来处理骨灰问题，如选择专门的骨灰存放场所或遵循当地的丧葬习俗，以维护社区的和谐与稳定。
可能的法律后果：
- 如果未经其他业主同意或违反小区管理规定，在商品房内存放骨灰，可能面临其他业主的投诉、诉讼或要求停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等法律责任。
- 如果因此造成房屋价值贬损或影响房屋的正常使用，还可能面临房屋出售或出租时的困难。
综上所述，虽然法律上没有明确规定禁止在商品房内存放骨灰，但鉴于可能引发的多方面问题，建议谨慎对待并寻求合法合规的解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。