当您在申请劳动仲裁时发现劳动合同丢失，确实可能会感到焦虑，但请放心，劳动合同并非证明劳动关系的唯一证据。以下是我为您详细梳理的应对步骤和建议：
一、理解法律依据，明确权利
首先，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关规定，您与用人单位发生劳动争议时，有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁过程中，虽然劳动合同是重要证据，但并非不可或缺。只要您能通过其他方式证明劳动关系的存在，仲裁委员会依然会受理您的申请。
二、积极收集替代证据
为了证明劳动关系的存在，您可以积极收集以下替代证据：
工资支付记录：如银行转账记录、工资条等，这些记录能直接反映用人单位向您支付劳动报酬的情况，是证明劳动关系的有力证据。
社保缴纳记录：社保缴纳是用人单位的法定义务，社保缴纳记录可以作为证明您与用人单位之间存在劳动关系的重要依据。
工作证、服务证：这些证件通常包含您的姓名、职务、工作单位等信息，能够初步证明您与用人单位的关联。
考勤记录：如打卡记录、签到表等，这些记录能证明您的工作时间和出勤情况，进一步佐证劳动关系的存在。
同事证言：如果有同事愿意为您作证，他们的证言也可以作为证明劳动关系的辅助证据。但请注意，证人证言的证明力相对较弱，最好与其他证据相互印证。
其他书面材料：如入职登记表、岗位调动通知、培训记录等，这些材料也可能包含有关劳动关系的信息，值得您仔细查找和整理。
三、申请劳动仲裁并详细说明情况
在收集了足够的替代证据后，您可以向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。在申请书中，请详细说明劳动合同丢失的情况，并提供已收集的替代证据清单及证据内容。同时，按照仲裁委员会的要求填写相关表格，确保申请材料的完整性和准确性。
四、配合仲裁委员会的调查和审理
仲裁委员会在受理案件后，可能会要求双方提供进一步的证据或进行举证质证。请您积极配合仲裁委员会的调查和审理工作，如实陈述事实，提供必要的协助。如果仲裁委员会认为有必要，还可能会进行现场调查或询问相关人员以核实情况。
五、额外建议
尽快行动：一旦发现劳动合同丢失，请尽快开始收集替代证据并申请劳动仲裁，以免错过时效期限。
保持冷静：虽然劳动合同丢失可能会给您带来一些困扰，但请保持冷静和理性，按照法律程序逐步解决问题。
咨询专业人士：如果您在收集证据或申请仲裁过程中遇到困难，不妨咨询专业的劳动法律师或法律援助机构，他们可以提供更具体的指导和帮助。
总之，劳动合同丢失并不妨碍您通过其他有效证据证明劳动关系并申请劳动仲裁。请您充分利用法律规定，积极维护自己的合法权益。