事业单位周末加班是否违法，需根据具体情况及法律规定来综合判断。以下是对此问题的全面分析：

1. 一般情况下的合法性判断：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条和《国务院关于职工工作时间的规定》第七条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度，且国家机关、事业单位实行统一的工作时间，星期六和星期日为周休息日。
   • 在一般情况下，事业单位应遵守上述工作时间和休息日规定，确保员工有足够的休息时间。若无法定理由而要求员工周末工作，则可能违反法律，侵犯了员工的休息权。

2. 特殊情况下的加班合法性：

   • 在特定情况下，如自然灾害、事故等紧急事件，或涉及公共利益、完成紧急任务时，事业单位可依法安排员工周末加班。
   • 但即使在这些特殊情况下，事业单位也应事后给予员工适当的补偿，如支付加班费或安排补休。根据《劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。

3. 加班的合法程序与条件：

   • 加班应当建立在与工会和劳动者协商一致的基础上，不能单方面强制要求员工加班。
   • 加班时间也应受到限制，一般情况下，每日延长工作时间不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，每日也不得超过3小时，且每月累计不得超过36小时。

4. 劳动者的应对措施：

   • 面对事业单位的周末加班要求，劳动者首先应与用人单位进行沟通协商，要求其停止违法行为或提供适当的补偿。
   • 协商不成的，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对违法行为进行调查和处理。
   • 劳动者还可以选择申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自身的合法权益。

实际应用与指导意义：

• 事业单位管理：事业单位应建立健全的工作制度和休假制度，确保员工权益得到保障。在安排员工周末工作时，应充分考虑法律要求和员工感受，合理安排工作任务和补偿措施。
• 员工权益保护：员工应了解自己的合法权益，包括工作时间、休息日和加班费等方面的规定。如遇单位违法安排周末工作且未提供适当补偿的情况，员工应积极维护自己的合法权益。

综上所述，事业单位周末加班的合法性取决于具体的工作安排、补偿措施以及是否符合相关法律规定。事业单位应严格遵守法律法规，确保员工权益得到妥善保护；同时，员工也应积极了解自己的权益，并在必要时采取法律手段来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。