公司设置两套账是违法的，这一结论基于明确的法律依据和实际法律风险分析得出。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据
《中华人民共和国公司法》：
- 根据《中华人民共和国公司法》第一百七十一条，公司除法定的会计账簿外，不得另立会计账簿。这一规定直接禁止了公司设置两套账的行为，确保了会计信息的统一性和真实性。
《中华人民共和国会计法》：
- 各单位必须根据实际发生的经济业务事项进行会计核算，填制会计凭证，登记会计账簿，编制财务会计报告，不得做假账。设置两套账若涉及虚假记载或隐瞒真实情况，将违反会计核算的真实性原则，面临法律制裁。
《中华人民共和国税收征收管理法》：
- 若公司通过两套账隐瞒收入、虚增成本以逃避税款，将严重违反税收征收管理法，构成偷税行为。税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以高额罚款；情节严重时，还可能追究刑事责任。
二、法律风险分析
行政处罚风险：
- 公司设置两套账一旦被发现，将面临税务机关的行政处罚，包括追缴税款、滞纳金和罚款等。这些处罚不仅会对公司的财务状况造成严重影响，还会损害公司的声誉和信誉。
刑事责任风险：
- 如公司通过两套账进行财务造假，情节严重的可能构成犯罪，如妨害清算罪、虚假破产罪等。这些罪行将导致直接负责的主管人员和其他直接责任人员面临有期徒刑、拘役及罚金等刑罚。
商业信誉损失：
- 设置两套账还会损害公司的商业信誉。在商业合作中，诚信是基石。一旦公司被发现存在财务造假行为，将失去合作伙伴的信任和支持，进而影响公司的长期发展。
三、合法情况下的多套账设置（虽不常见，但需明确）
- 企业出于管理需要，可能在同一会计主体内编制多套辅助账套，用于内部管理、决策支持等。但这些账套必须基于真实的经济业务事项进行核算，且不得违反相关法律法规。只要建账目的合法、核算基础真实，且接受相关监管部门的监督，则不构成违法。然而，这种情况在实际操作中极为罕见，且需严格遵守法律法规和监管要求。
四、建议与总结
加强法制观念：
- 公司应严格遵守相关法律法规，确保会计信息的真实性和完整性。这是公司合法经营的基础，也是避免法律风险的关键。
完善财务管理制度：
- 公司应建立健全的财务管理制度，确保所有会计活动都符合法律法规的要求。这包括设置合理的会计科目、编制准确的会计凭证和账簿、编制合规的财务会计报告等。
提升财务人员素养：
- 公司应加强对财务人员的培训和教育，提升他们的专业素养和职业道德水平。财务人员是公司会计信息的主要编制者和提供者，他们的素养直接影响到会计信息的质量。
积极配合监管：
- 公司应积极配合外部监管和审计工作，及时整改存在的问题。这有助于公司及时发现和纠正潜在的财务问题，避免法律风险的发生。
综上所述，公司设置两套账是违法的行为，将面临严重的法律后果。公司应坚决避免此类行为，确保会计信息的真实性和完整性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。