医疗期内协商解除劳动合同，用人单位通常需要支付的费用主要包括经济赔偿金、可能的医疗补助费，以及确保劳动者应得工资及福利待遇的支付。以下是对这些费用的详细解释：

1. 经济赔偿金：

   • 法律依据：根据《劳动合同法》及相关规定，医疗期内用人单位不得随意解除劳动合同。若违法解除，需支付经济赔偿金。
   • 计算方式：经济补偿按劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资计算。每满一年支付一个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。赔偿金为经济补偿标准的二倍。
   • 示例：若劳动者在单位工作了3年7个月，前12个月平均工资为5000元，单位在其医疗期内违法解除劳动合同，则劳动者可获得的赔偿金为4个月工资的二倍，即40000元（5000元×4个月×2倍）。

2. 医疗补助费：

   • 法律依据：虽然原劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》中关于医疗补助费的规定部分已废止，但在司法实践中，一些地区仍会参考此规定，要求用人单位支付医疗补助费，特别是当劳动者患病或非因工负伤，经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作或用人单位另行安排的工作时。
   • 支付标准：通常不低于六个月工资，患重病者增加部分不低于医疗补助费的百分之五十，患绝症者增加部分不低于百分之百。具体支付标准可能因地区差异和案件情况而异。

3. 应得工资及福利待遇：

   • 法律依据：医疗期内，劳动者有权获得相应的工资和福利待遇，用人单位不得因解除合同而克扣或拖欠。
   • 支付内容：包括基本工资、奖金、津贴、补贴等，以及社会保险、住房公积金等福利待遇。

特殊情形处理：

• 若劳动者存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形，如严重违反用人单位规章制度等，即使在医疗期内，用人单位也可解除劳动合同且无需支付经济补偿或赔偿金。但用人单位需确保劳动者确实存在这些法定过错情形，并有充分证据支持。

劳动者维权途径：

• 若用人单位在医疗期内违法解除劳动合同，劳动者可通过收集证据（如劳动合同、工资条、医疗诊断证明等）、与公司协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径维权。

建议：

• 劳动者在医疗期内应保留好相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。
• 用人单位在解除劳动合同时应严格遵守法律法规，避免违法解除带来的法律风险和经济损失。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。