员工自离后，用人单位不发工资的行为在大多数情况下是违法的。不过，具体是否违法还需结合实际情况来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、劳动者获得劳动报酬的权利

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这表明，无论劳动者以何种方式离职，只要其提供了正常的劳动，就依法享有获得相应工资的权利。自离只是解除劳动合同的一种方式，并不影响劳动者已经付出劳动所对应的工资权益。

二、用人单位支付工资的义务

《工资支付暂行规定》第九条也明确规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，即便劳动者自离，用人单位也有义务一次性结清其应得的工资。

三、自离行为与工资支付的独立性

劳动者的自离行为可能违反了公司的规章制度，但这并不构成用人单位拒绝支付工资的理由。自离行为与劳动者已经付出的劳动以及应得的工资是两个不同的法律关系。如果劳动者的自离给公司造成了损失，用人单位可以通过法律途径要求劳动者赔偿，但不能以此为由拒付工资。

四、用人单位的合法处理措施

当然，用人单位并非完全不能对劳动者的自离行为采取措施。如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了员工自离的后果（如扣除部分工资作为违约金或赔偿金），并且这些规定是合法且合理的，那么公司在员工自离后按照这些规定执行可能是合法的。但前提是：

1. 这些规定必须合法且合理，不得违反法律法规的强制性规定，如扣除工资的比例不得超过法律规定的限制（每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准）。
2. 用人单位需要有充分的证据证明损失的存在以及损失与劳动者自离行为之间的因果关系。

五、实际操作中的建议

1. 对于劳动者而言：

   • 在离职前尽量与用人单位进行充分沟通，并按照相关法律法规和规章制度的要求办理离职手续，以避免不必要的纠纷。
   • 如果遇到自离后用人单位不给工资的情况，可以先与用人单位协商；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付；也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

2. 对于用人单位而言：

   • 应确保规章制度和劳动合同的合法性，并合理处理劳动者的离职事宜，避免因不当处理而引发法律纠纷。
   • 在制定规章制度时，应明确员工自离的后果及处理方式，并确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。

综上所述，员工自离后不发工资的行为在大多数情况下是违法的。双方应通过协商和沟通来解决问题，必要时可寻求法律援助以维护自身合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。