结论：公司是否会知道员工的案底，主要取决于查询的合法性、必要性以及员工的个人披露情况。在大多数情况下，公司无法直接获取员工的犯罪记录等隐私信息，但在特定行业或岗位，以及员工授权的情况下，公司可能通过合法途径了解到这些信息。以下是对这一问题的详细分析：

一、普通公司的查询权限与方式

1. 难以直接查询：

   • 普通公司通常没有直接查询个人犯罪记录的权限。犯罪记录属于个人隐私信息，受到法律的严格保护。司法机关等相关部门对犯罪记录有严格的管理和使用规定，不会随意向企业透露。

2. 可能的间接了解方式：

   • 员工主动告知：在招聘或入职时，公司可能会要求员工填写包含是否有犯罪记录等问题的背景信息表格。若员工如实填写，公司则会知晓。
   • 第三方背景调查（需授权）：部分高要求企业可能在获得员工授权后，委托专业背景调查公司通过合法渠道查询犯罪记录。这需符合相关规定和程序，且通常仅针对特定岗位或高级管理人员。

二、特定行业或特殊岗位的查询要求

对于某些特定行业或岗位，法律法规明确要求从业人员必须具备无犯罪记录等条件，企业在招聘时会进行严格的背景审查：

• 金融行业：如银行、证券、保险等领域的关键岗位，需具备良好的信誉和无违法犯罪记录，以确保金融安全。监管部门可能要求金融机构对拟录用人员进行包括犯罪记录查询在内的背景调查。
• 教育行业：学校、教育机构在招聘教职工，特别是与未成年人密切接触的岗位时，会进行背景审查以保障未成年人的安全。这通常包括查询犯罪记录，特别是涉及暴力、性犯罪等记录。
• 交通运输行业：如出租车、网约车司机等职业，一些地方要求驾驶员无犯罪记录，运输管理部门在核发从业资格证件时会进行审查。
• 公职岗位：国家机关、事业单位招录公职人员时，会进行严格的政治审查，包括查询犯罪记录。涉及国家安全、商业机密保护等敏感岗位的企业也可能进行类似调查。

三、特殊情况下的查询与隐私保护

• 公开报道的情况：如果个人因重大刑事案件或社会事件被公开报道，公司可能通过网络搜索等方式获取到这些信息。但即使如此，公司仍需遵守相关法律法规和隐私政策，不能随意使用这些信息。
• 尊重隐私权利：保护个人隐私是一项重要权利。无论公司是否知晓员工的案底，都应尊重并遵守相关法律法规和隐私政策，确保信息的合法使用和保密。员工也有权依法维护自己的隐私权，如果公司非法查询或泄露其犯罪记录信息，员工可以采取法律手段进行维权。

四、法律建议

1. 对于员工：

   • 在入职时，应如实填写公司要求的背景信息表格，包括是否有犯罪记录等。故意隐瞒可能导致后续被解雇，并可能因违反诚信原则而承担法律责任。
   • 如果公司要求提供无犯罪记录证明，应按照公司要求前往公安机关开具，并确保证明的真实性和有效性。

2. 对于公司：

   • 在招聘过程中，应严格遵守相关法律法规和隐私政策，不得非法查询或泄露应聘者的犯罪记录信息。
   • 对于需要查询犯罪记录的特定岗位或行业，应确保查询的合法性和必要性，并获得应聘者的明确授权。
   • 在获取到应聘者的犯罪记录信息后，应妥善保管并确保信息的保密性，不得随意泄露或用于非法目的。

综上所述，公司是否会知道员工的案底取决于多种因素，包括查询的合法性、必要性以及员工的个人披露情况。在大多数情况下，公司无法直接获取员工的犯罪记录等隐私信息；但在特定情况下，如员工授权或法律法规要求时，公司可能通过合法途径了解到这些信息。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。