当员工因公司未依法缴纳社保而提起劳动仲裁时，劳动仲裁机构会依据一系列法定程序和相关法律法规来处理这一争议。以下是对整个处理流程的详细阐述：

一、申请仲裁阶段

员工需要向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请。在申请书中，员工应详细载明自己的基本信息、仲裁请求（如要求公司补缴社保）、所根据的事实与理由（如公司未缴纳社保的具体情况）、以及相关证据和证据来源。同时，员工需注意，仲裁申请需在劳动争议发生之日起一年内提出，以确保权利的及时行使。

二、受理审查阶段

劳动争议仲裁委员会在收到仲裁申请后，会在五日内进行审查。审查内容主要包括申请材料是否齐全、是否符合受理条件（如申请人与被申请人之间是否存在劳动关系、申请事项是否属于劳动争议范围等）。如果符合受理条件，仲裁委员会将正式受理并通知申请人；如果不符合条件，则会书面通知申请人不予受理，并明确说明理由。

三、准备与答辩阶段

仲裁委受理后，会将仲裁申请书副本送达被申请人（即公司），以便其了解仲裁请求及事实依据。公司需在规定时间内（通常为十日内）向仲裁委提交答辩书，针对员工的仲裁请求进行回应和辩解。同时，仲裁委还会在开庭五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人，确保双方能够充分准备并参与庭审。

四、开庭审理与调查取证阶段

在庭审环节，双方当事人将出席庭审，进行陈述、举证、质证和辩论等。这是查明案件事实、分清责任的关键阶段。仲裁庭有权根据需要自行调查取证，如向社保部门核实公司的社保缴纳情况等，以确保裁决的公正性和准确性。

五、调解与裁决阶段

在查明事实的基础上，仲裁庭会尝试进行调解，促使双方就社保问题达成一致解决方案。调解遵循自愿、合法的原则。如果调解不成，仲裁庭将根据审理情况和相关法律法规进行裁决。裁决内容可能包括补缴社保、支付经济补偿等。具体补缴的险种、时间段和金额以及经济补偿的标准将根据实际情况确定。

六、执行阶段

双方应按照裁决内容执行。如果公司未履行裁决义务，员工可以向法院申请强制执行。法院有权采取多种强制执行措施，如查询、冻结、划拨公司的银行存款，查封、扣押、拍卖公司的财产等，以确保裁决得以执行。

七、特殊情况处理与法律依据

• 特殊情况处理：若公司账户余额不足以缴纳社会保险费且未提供担保，社会保险费征收机构可以申请人民法院扣押、查封、拍卖其价值相当于应当缴纳社会保险费的财产，以拍卖所得抵缴社会保险费。
• 法律依据：根据《中华人民共和国社会保险法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，企业有义务为员工缴纳社保，未缴属违法行为。员工可要求强制补缴并追究相应责任。同时，因未缴社保导致的工伤赔偿、生育津贴等损失，公司应全额承担。

八、注意事项

• 时效问题：员工应在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起的一定期限内（通常为一年）提出仲裁申请。超过这个期限，可能会丧失胜诉权。
• 证据收集：员工在提起仲裁前，应尽可能收集与公司存在劳动关系以及公司未缴纳社保的证据。这些证据将有助于支持其主张并提高胜诉的可能性。

综上所述，当员工因公司未依法缴纳社保而提起劳动仲裁时，劳动仲裁机构会按照法定程序进行受理、审查、准备、答辩、开庭审理、调解与裁决。员工应准备好相关证据和材料，积极参与仲裁过程，以维护自己的合法权益。同时，公司也应依法履行社保缴纳义务，避免不必要的法律纠纷和经济损失。