公司和员工签订合作协议，在符合一定条件下是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

一、协议有效的基本条件

1. 主体合格

   • 公司方面：必须是依法成立并具有合法经营资格的主体，能够独立承担民事责任。例如，有限责任公司、股份有限公司等，只要取得了营业执照，就具备了签订合作协议的主体资格。
   • 员工方面：需达到法定就业年龄，通常年满16周岁（特殊行业另有规定除外），具备相应的民事行为能力和劳动能力。若未满18周岁但以自己的劳动收入为主要生活来源，也视为具有民事行为能力，可以签订合作协议。

2. 意思表示真实

   • 协议签订必须基于双方在平等、自愿、公平的基础上真实表达自己的意愿。不存在欺诈、胁迫、重大误解等导致意思表示不真实的情形。例如，公司不能以虚假承诺高额回报诱使员工签订合作协议，员工也不能在受到胁迫的情况下签订协议。

3. 内容合法合规

   • 协议内容不得违反法律法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益及第三人的合法权益。具体条款如合作方式、利益分配、风险承担等应符合相关法律法规要求。例如，不能约定员工承担全部经营风险而公司不承担任何责任，这样的条款可能因违法而无效。

4. 形式符合要求

   • 合作协议应采用书面形式，并可能需要满足盖章、签字等特定形式要件以确保其法律效力。书面形式有助于明确双方的权利义务，避免口头协议可能带来的纠纷。

二、特殊情况下的协议效力

1. 亲属关系的影响

   • 员工与公司间的亲属关系本身不影响协议的效力。但在解释和履行协议时，法院可能会综合考虑此因素。例如，在亲属间签署的合作协议中，如果条款存在模糊或不明确的地方，法院可能会倾向于保护相对弱势一方的利益。因此，在亲属间签署协议时，建议更明确地约定权利义务以避免纠纷。

2. 空白合同的效力

   • 让员工签署空白合作协议存在法律风险。若员工能证明是在不知情或被迫情况下签署，且协议内容对其不利，该协议可能被视为无效或部分无效。然而，举证责任较重，员工需提供充分证据支持主张。因此，员工在签署合作协议时，应仔细阅读协议内容，确保所有条款都明确无误。

三、无效或部分无效的情形

1. 违反法律法规强制性规定

   • 如约定的利益分配方式违反税收法规、合作方式违反行业监管规定等条款，因违法而无效。例如，如果合作协议中约定通过非法手段获取利益，这样的条款显然是无效的。

2. 存在欺诈、胁迫等情形

   • 一方以欺诈、胁迫手段使对方违背真实意思订立的协议可撤销。例如，公司虚假陈述合作项目的前景和收益，诱使员工签订合作协议，员工在发现真相后有权请求撤销协议。

3. 显失公平

   • 协议内容明显不公平且严重损害一方合法权益时可撤销。如公司在合作协议中约定员工承担全部经营风险而只分配极少的利益，这样的条款可能因显失公平而被撤销。

4. 排除员工主要权利或免除公司主要责任

   • 协议中约定排除员工依法享有的主要权利或免除公司应承担的主要责任的条款无效。例如，约定员工在任何情况下都不得主张合作收益或公司对合作项目的损失概不负责等条款，都是无效的。

四、法律建议

1. 在签订合作协议前，双方应充分了解相关法律法规，确保协议内容合法合规。
2. 协议条款应明确具体，避免模糊和歧义，以减少后续纠纷的可能性。
3. 在签署协议前，双方应仔细阅读协议内容，确保所有条款都符合自己的意愿和利益。
4. 如遇任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。

总之，公司和员工签订合作协议在符合一定条件下是合法的。但为了确保协议的合法性和有效性，双方应严格遵守相关法律法规要求，并在实际操作中谨慎处理特殊情况。如有需要，你可以直接向我咨询相关法律问题。