上游企业是否会被牵连，取决于其是否知情或参与虚开发票行为，具体分以下两种情况分析：

1. 上游企业不知情且未参与虚开行为
   若上游企业与下游无合谋，且在交易中履行了基本审查义务（如核对合同、资金流、货物/服务真实性），即使下游虚开发票，上游通常不会被追究刑事责任。但需注意：税务机关可能要求上游配合调查，提供交易凭证（如发货单、付款记录等）自证清白；若上游存在管理漏洞（如未留存完整交易记录），可能面临行政处罚（如罚款、滞纳金）。

2. 上游企业知情或参与虚开行为
   若上游与下游存在共同虚开故意（如通过伪造合同、资金回流等方式配合虚开），则构成共同犯罪，需承担刑事责任。根据《刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票罪的刑罚包括：

   • 三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元至二十万元罚金；
     
   • 数额较大或情节严重（如虚开税款数额10万元以上），处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元至五十万元罚金；
     
   • 数额巨大或情节特别严重（如虚开税款数额50万元以上），处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处五万元至五十万元罚金或没收财产。
     此外，上游企业还需补缴税款、缴纳滞纳金，并可能被列入税收违法“黑名单”，影响企业信用和经营。

实务建议：

• 上游企业应建立严格的交易审查机制，留存合同、发货单、付款凭证等完整证据链；
  
• 定期自查发票合规性，避免与高风险客户（如频繁变更开票信息、资金异常回流）合作；
  
• 若发现下游虚开，立即终止合作并向税务机关举报，以降低自身风险。
  

如有具体案件细节（如虚开金额、参与程度等），可进一步向我咨询，我会结合证据分析法律风险。