工伤期间全勤奖是否扣除，需综合考虑法律法规、公司规章制度以及具体情况，原则上在停工留薪期内不应扣除，但具体还需依据实际情况判断。以下是从不同角度的详细分析：
一、法律依据与原则
根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常包括员工受伤前正常出勤时的所有待遇，全勤奖作为工资福利的一部分，在停工留薪期内原则上不应被扣除。因为工伤停工是法律赋予的权利，员工因非主观原因缺勤，其全勤奖不应因此受到影响。
二、公司规章制度的考量
尽管法律规定了工伤期间的待遇原则，但实际操作中还需考虑公司的具体规章制度。若公司规章制度明确规定全勤奖严格依据实际出勤天数发放，且该制度经过民主程序制定、内容合法并已向员工公示，那么公司在工伤期间可能会依据此规定扣除全勤奖。然而，这种扣除可能引发争议，因为工伤停工是法律赋予的权利，严格扣除可能与《工伤保险条例》的立法精神相悖。因此，建议公司在制定规章制度时，应充分考虑工伤职工的特殊情况，合理设置全勤奖的发放条件。
三、实际操作与建议
查阅公司规定：员工应仔细查阅所在公司的相关规章制度或劳动合同，了解全勤奖的具体发放条件及工伤期间的待遇规定。这有助于员工明确自己的权益，并在必要时与公司进行协商。
与公司协商：如对公司规定有疑问或认为不合理，员工应积极与部门或人力资源部门进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。在协商过程中，员工可以引用《工伤保险条例》的相关规定，维护自己的合法权益。
法律途径：若协商无果，员工可以依法通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，员工应收集相关证据，如工伤认定书、医疗证明、公司规章制度等，以支持自己的主张。
四、特殊情况处理
值得注意的是，有些公司出于人道主义关怀和员工福利的考虑，可能会在工伤期间继续发放全勤奖或其他形式的补贴。这种情况下，员工应珍惜并感激公司的关怀，同时遵守公司的相关规定。如果公司愿意在工伤期间继续发放全勤奖，这无疑是对员工的一种额外照顾，员工应予以理解和尊重。
综上所述，工伤期间全勤奖的扣除与否并非一概而论，而是需综合考虑法律法规、公司规章制度及实际情况。在处理此类问题时，建议员工和公司都保持理性、公正的态度，共同寻求合理合法的解决方案。如果您在工伤期间遇到全勤奖被扣除的问题，或者有其他任何法律疑问，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。