非法打井一般归水行政主管部门（如水利局）管理，若涉及其他违法情形，还可能涉及其他部门联合管理。以下从不同角度为你详细分析：

从水资源管理角度

根据我国相关法律法规，水资源属于国家所有，对水资源的开发、利用、保护等都有严格的规定。打井涉及到对地下水的开采，这属于水资源开发利用的范畴。水行政主管部门（通常是各地的水利局）负责水资源的统一管理和监督工作，包括对取水许可的审批、对水资源开发利用活动的监管等。

如果打井行为没有经过合法的取水许可审批程序，就擅自打井取水，这属于非法打井行为，水行政主管部门有权对其进行查处。例如，依据《中华人民共和国水法》第六十九条规定，有下列行为之一的，由县级以上人民政府水行政主管部门或者流域管理机构依据职权，责令停止违法行为，限期采取补救措施，处二万元以上十万元以下的罚款；情节严重的，吊销其取水许可证：（一）未经批准擅自取水的；（二）未依照批准的取水许可规定条件取水的。非法打井取水往往就属于未经批准擅自取水的情况。

从土地管理角度

打井需要在土地上进行施工，如果打井行为违反了土地管理方面的法律法规，如未经批准擅自占用土地打井，或者打井破坏了耕地等，那么国土资源管理部门（现在一般称为自然资源和规划局）也会介入管理。

例如，根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条规定，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。如果打井行为非法占用了土地，就可能面临国土资源管理部门的处罚。

从环境保护角度

如果打井行为对周边环境造成了污染或者破坏，如打井过程中导致地下水污染、土壤污染等，那么环境保护部门（生态环境局）也会依据相关环境保护法律法规进行管理和处罚。

例如，根据《中华人民共和国环境保护法》第六十八条规定，地方各级人民政府、县级以上人民政府环境保护主管部门和其他负有环境保护监督管理职责的部门，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予记过、记大过或者降级处分；造成严重后果的，给予撤职或者开除处分，其主要负责人应当引咎辞职。如果打井行为造成了环境污染事故，相关责任部门和人员可能会受到上述处分，同时打井者也可能面临环境保护部门的罚款等处罚措施。

在实际生活中，如果发现非法打井行为，你可以向当地的水行政主管部门、国土资源管理部门或者环境保护部门进行举报。如果你在拆迁安置、经济纠纷领域遇到法律问题，也可以直接向我咨询。