结论：每天工作12小时在一般情况下是不合法的，但在特定情况下，如经过劳动行政部门批准的特殊工时制度、紧急特殊情况或劳资双方协商并得到审批等，可能是合法的。

法律分析

1. 一般情况下的不合法性

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是保障劳动者休息权益、维护其身体健康的基本法律原则。因此，在常规情况下，要求员工每天工作12小时显然超出了法定的每日工作时间上限，构成违法行为。

1. 特殊情况下的合法性分析

   • 特殊工时制度：对于因工作性质和生产特点不能实行标准工时制度的企业，如交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等需要连续作业的特殊行业，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制。在综合计算周期内，虽然某一具体日（或周）的实际工作时间可能超过8小时（或40小时），但整个周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。这种情况下，每天工作12小时可能是合法的。

   • 紧急特殊情况：在发生自然灾害、事故或其他威胁劳动者生命健康和财产安全的情况下，或者生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障且必须及时抢修时，根据《劳动法》第四十二条的规定，延长工作时间可以不受上述法定限制。这是为了应对突发状况、保护公共利益和劳动者安全而做出的特殊规定。

   • 劳资双方协商与审批：虽然不常见，但在某些情况下，如果劳资双方就工作时间进行了协商，并且得到了劳动行政部门的批准，那么即使工作时间超过了法定限制，这种安排也可能是合法的。但这需要严格的审批程序和双方的明确同意。

2. 加班的合法性及限制

即使是在需要加班的情况下，根据《劳动法》第四十一条的规定，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，且每月不得超过三十六小时。超出此范围的加班均属违法，即使与劳动者协商一致也不能违反法律规定。

劳动者权益保护

• 如果用人单位违反工时规定，强制要求员工长时间工作并未按规定支付相应薪资，将被视为严重违法行为。
• 劳动者有权拒绝超过法定工作时间的工作安排，并有权要求用人单位支付加班费或进行相应的补偿。加班费的标准为：平时加班支付不低于工资的150%的报酬；休息日加班又不能安排补休的，支付不低于工资的200%的报酬；法定休假日加班的，支付不低于工资的300%的报酬。
• 劳动者可通过与用人单位协商解决争议，协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自身权益。

总结与建议

综上所述，每天工作12小时是否合法取决于具体情况。在正常情况下，这种安排是违法的；但在特殊情况下或经过特殊程序批准后，它可能是合法的。因此，劳动者应充分了解自己的工作时间权益，并在必要时采取适当措施维护自身合法权益。如果用人单位存在违法行为，劳动者应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保工时安排的合法性和合理性。

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