当超过60岁的农民工发生工伤时，其赔偿问题确实需要结合实际情况及法律规定来综合处理。以下是我为您详细梳理的赔偿流程、赔付责任主体以及相关注意事项：

一、确认劳动关系与工伤认定

1. 劳动关系确认：

   • 超过60岁的农民工可能已享受养老保险待遇或达到法定退休年龄，此时与用人单位的关系可能被认定为劳务关系。但若能证明仍在从事劳动且未享受养老保险待遇，仍有可能被认定为劳动关系。劳动关系是申请工伤认定的前提。

2. 工伤认定：

   • 若存在劳动关系，受伤农民工或其近亲属可在事故伤害发生之日起一年内，向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 申请时需提交工伤认定申请表、医疗诊断证明等相关材料。

二、劳动能力鉴定

• 经治疗伤情相对稳定后，若存在残疾或影响劳动能力，可向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定。
• 劳动能力鉴定结果将作为确定伤残等级和赔偿标准的重要依据。

三、赔付责任主体与赔偿项目

赔付责任的确定需综合考虑农民工是否享受养老保险待遇、用人单位是否缴纳工伤保险以及事故责任归属等因素。

1. 未享受养老保险待遇或领取退休金的超龄农民工：

   • 已缴纳工伤保险：赔偿责任主要由工伤保险基金和用人单位分别承担。例如，医疗费用、康复费用等由工伤保险基金支付；停工留薪期内的工资福利等由用人单位支付。
   • 未缴纳工伤保险：由用人单位按照《工伤保险条例》规定的工伤保险待遇项目和标准全额支付费用。

2. 已享受养老保险待遇或领取退休金的超龄农民工：

   • 通常按劳务关系处理，不能认定为工伤。此时，根据《中华人民共和国民法典》等民事法律规定来处理赔偿问题。
   • 雇主或用工单位责任：雇主或用工单位应承担相应的赔偿责任，包括医疗费、误工费、护理费等。
   • 保险机构责任（如适用）：如果雇主购买了相关商业保险，保险机构也应在保险责任范围内承担赔付责任。
   • 第三方责任：如果受伤是由于第三方的过错导致的，第三方也应承担相应的赔偿责任。

3. 赔偿项目：

   • 包括医疗费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金（如适用）、一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金（部分地区可能不支持）、住院伙食补助费、交通食宿费等。

四、赔偿流程与注意事项

1. 协商赔偿：

   • 首先尝试与用人单位协商解决赔偿事宜，这是最直接且成本较低的方式。

2. 劳动仲裁或诉讼：

   • 若协商不成，可依法申请劳动仲裁或提起诉讼。在此过程中，建议寻求专业律师的帮助，以更好地维护自身合法权益。

3. 关注政策差异：

   • 不同地区对于超龄农民工工伤赔偿的政策可能存在差异，需密切关注当地相关规定，确保赔偿请求符合当地政策要求。

4. 收集证据材料：

   • 在处理此类案件时，要注意收集相关证据材料，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等，以便更好地支持自己的主张。

综上所述，超过60岁的农民工发生工伤后的赔偿问题需根据具体情况来确定赔付责任主体和赔偿项目。在处理此类案件时，应综合考虑相关法律法规和政策规定，确保受伤农民工的合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询专业律师或当地社保部门。