员工给公司造成损失时的赔偿标准是一个涉及多方面因素的问题，需要综合考虑法律法规、劳动合同约定、公司规章制度、员工过错程度、损失类型与金额以及工资扣除限制等多个方面。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据
《工资支付暂行规定》第十六条：
- 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿。
- 赔偿可从工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
《劳动法》及《劳动合同法》相关条款：
- 劳动者违反法律规定或劳动合同约定，对用人单位造成经济损失的，应承担赔偿责任。
- 用人单位需通过民主程序制定规章制度（如《员工手册》），明确赔偿责任和流程，并向员工公示。
《民法典》侵权责任编：
- 若员工存在重大过失或故意行为，可能需承担民事赔偿责任。
二、赔偿原则
过错程度：
- 轻微过失：如操作失误导致小额损失，通常免赔或通过培训改进。
- 一般过失：按责任比例赔偿，考虑员工收入水平，赔偿比例可能在50%-80%之间。
- 重大过失/故意：全额赔偿，并可能面临纪律处分甚至解雇。
因果关系：
- 需证明损失与员工行为直接相关，排除外部因素（如市场波动）的影响。
合理性：
- 赔偿金额应合理，避免过度惩罚。例如，月薪5000元的员工，不应被要求赔偿远超其经济承受能力的金额。
三、赔偿标准的确定因素
劳动合同约定：
- 若劳动合同中有关于员工因故意或重大过失给公司造成损失的赔偿约定，且不违反法律法规强制性规定，则按约定执行。
公司规章制度：
- 公司经过民主程序制定且已公示的规章制度，可作为处理员工赔偿的依据。但需确保制度内容合法、合理，且已向员工明确告知。
员工过错程度：
- 根据员工的过错程度（故意、重大过失、一般过失）来确定赔偿责任的大小。
损失类型与金额：
- 直接损失：员工需赔偿因其行为直接导致的公司财产减少或损坏。
- 间接损失：是否要求员工赔偿间接损失需结合具体情况判断，需证明损失与员工行为有直接因果关系且损失合理。
工资扣除限制：
- 即使员工需承担赔偿责任，每月从其工资中扣除的部分也不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
四、实际操作建议
充分沟通协商：
- 公司与员工应首先进行充分沟通，尝试通过协商达成赔偿协议。这有助于维护双方关系，减少冲突。
遵循法律程序：
- 协商不成时，公司可依法通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径解决赔偿问题。确保赔偿方案的合法性和合理性。
增强责任意识：
- 员工应增强工作责任心，避免因个人原因给公司造成损失。公司也应加强管理和培训，降低经营风险。
完善制度与证据收集：
- 公司应完善相关规章制度，明确赔偿责任和流程。同时，保存监控录像、工作记录、邮件往来等证据，确保责任认定清晰。
五、示例
假设某员工因操作失误导致公司设备损坏，设备折旧后价值为1万元。根据公司的规章制度和员工的过错程度（一般过失），公司决定要求员工赔偿设备价值的60%，即6000元。考虑到员工的经济承受能力，公司决定分6个月从员工的工资中扣除赔偿金，每月扣除1000元。这样的处理方式既符合法律法规的要求，又体现了合理性和公平性。
综上所述，员工给公司造成损失时的赔偿标准需综合考虑多方面因素。在实际操作中，公司应确保赔偿方案的合法性和合理性，维护双方的合法权益。同时，员工也应了解自身权利，避免因赔偿纠纷引发更大法律风险。