结论前置：员工因不能胜任工作被辞退时，是否有赔偿取决于多种因素，包括是否满足法定条件及程序、是否在试用期内、以及用人单位是否履行了培训或调岗等前置程序。

一、合法解除劳动合同的情况

1. 试用期内解除：

   • 如果员工在试用期内被证明不符合录用条件（如不能胜任工作），且用人单位有充分证据证明这一点，那么用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第一项的规定，无需支付经济补偿金即可辞退员工。

2. 试用期外解除：

   • 对于过了试用期的员工，若不能胜任工作，用人单位需先对员工进行培训或者调整工作岗位。若经过这些措施后，员工仍然不能胜任工作，用人单位需提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，方可解除劳动合同。
   • 在这种情况下，用人单位需按照《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条的规定，向员工支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

二、违法解除劳动合同的情况

1. 未履行培训或调岗程序：

   • 如果用人单位未对不能胜任工作的员工进行培训或调整工作岗位，就直接以不能胜任工作为由辞退员工，这构成违法解除劳动合同。
   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条的规定，用人单位需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。

2. 缺乏充分证据：

   • 若用人单位无法提供充分证据证明员工不能胜任工作，如明确的岗位职责、合理的考核标准及员工不符合标准的相关证据，仅口头称员工不能胜任而将其辞退，同样构成违法解除劳动合同。
   • 在这种情况下，用人单位也需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。

三、特殊情况下的责任

• 如果员工不能胜任工作是由于用人单位未提供适当的培训或劳动条件造成的，用人单位在解除劳动合同时可能需要承担更大的责任，包括但不限于支付额外的经济补偿或赔偿金。

四、实际案例分析

• 假设员工小张在某公司工作了2年，月平均工资为5000元。若公司以小张不能胜任工作且经过培训后仍不能胜任为由合法解除劳动合同，则需向小张支付2个月工资的经济补偿，即10000元。若公司未提前三十日书面通知，还需额外支付一个月工资5000元。
• 若公司无任何证据证明小张不能胜任工作就直接将其辞退，则属于违法解除劳动合同，应向小张支付赔偿金。赔偿金为经济补偿（2×5000=10000元）的二倍，即20000元。

五、总结与建议

• 员工因不能胜任工作被辞退时，是否有赔偿取决于多种因素。用人单位在做出辞退决定时，应确保符合相关法律规定，包括有充分的证据证明员工不能胜任工作，以及已履行了培训或调岗等前置程序。
• 若用人单位确需辞退员工，建议严格按照法律规定的程序进行操作，以避免不必要的法律风险。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。