结论前置：综合工时制是一种针对特殊工作性质或受季节、自然条件限制的职工，采用以周、月、季、年为周期综合计算工作时间的灵活工时制度。以下是对综合工时制的详细解释：
一、综合工时制的基本规定与法律依据
- 定义：综合工时制，即综合计算工时工作制，它允许在一定周期内（如周、月、季、年）灵活安排工作时间，但必须确保总工作时间不超过法定标准，且需经劳动行政部门审批。
- 法律依据：主要依据《中华人民共和国劳动法》第三十九条及原劳动部《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》等规定实施。
二、适用范围
综合工时制适用于以下行业或岗位：
- 交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业：这些行业因工作性质特殊，需连续作业，如长途司机、船员、空乘人员等。
- 地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节或自然条件限制的行业：这些行业的工作受季节或自然条件影响较大，如冬季施工受限的建筑业、旅游旺季的景区工作人员等。
- 其他适合集中工作、集中休息的岗位：如电力抢修、新闻采编等需灵活应对突发任务的岗位。
三、工作时间计算与加班规定
- 工作时间计算：在综合计算周期内，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同（每日不超过8小时，每周不超过40小时）。例如，以月为周期，每月法定标准工作时间为166.64小时；以年为周期，全年则为2000小时左右。
- 加班规定：
- 若实际工作时间超过该周期的法定标准工作时间，超出部分视为延长工作时间，企业应支付不低于劳动者本人小时工资标准的150%的加班工资。
- 在法定节假日工作的，无论是否超过法定标准工作时间，企业都应支付不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%的加班工资。
四、实施流程
- 申请审批：企业需向当地劳动行政部门提出申请，包括营业执照副本复印件、实行综合计算工时工作制的岗位及人员范围、工作时间安排及休息休假办法等。经审核批准后，企业方可实行综合计算工时工作制。
- 公示告知：企业应将审批结果及工时制度内容通过合同、公告等方式告知劳动者，确保劳动者了解并同意。
- 记录管理：企业应保存考勤、工时统计等资料备查，保存期不少于2年，以便劳动行政部门进行监督和管理。
五、特殊保护与注意事项
- 休息休假权利：企业应确保实行综合计算工时工作制的职工有适当的休息时间，避免连续疲劳作业，保障劳动者身体健康。
- 女职工与未成年工保护：对于女职工和未成年工，企业还需遵守相关的特殊劳动保护规定，如不得安排女职工在经期从事高处、低温、冷水作业和国家规定的第三级体力劳动强度的劳动等。
- 合理确定劳动定额：企业应合理确定劳动者的劳动定额或其他考核标准，以便安排劳动者休息，并确保延长工作时间的小时数平均每月不得超过36小时。
- 健康保障：延长工作时间应在保障劳动者身体健康的条件下进行，企业应提供必要的劳动保护措施和休息时间。
六、案例解析
案例：某快递公司快递员实行年度综合工时制，全年总工时2000小时（日均约6.6小时），但“双十一”期间连续工作15天，每天12小时。
分析：
- 若年度总工时未超2080小时（52周×40小时），则“双十一”超时部分属加班，应支付加班费。具体计算方式为：超时小时数×小时工资标准×150%（若非法定节假日）或300%（若为法定节假日）。
- 若总工时已超限，则全部超时均需支付加班费，且可能面临劳动行政部门的处罚。
总结：综合工时制是一种既考虑企业生产需求又兼顾员工身心健康的工时制度。企业在实行时，必须严格遵守相关法律法规，合理安排员工的工作和休息时间，确保员工的合法权益得到充分保障。如果您在综合工时制方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。