离职时签署了保密协议，公司是否应该给补偿，这主要取决于保密协议中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、保密协议的基本内容与补偿情况
仅约定保密义务：
- 如果保密协议仅单纯约定了劳动者离职后的保密义务，而没有涉及竞业限制相关内容，那么公司通常不需要专门向劳动者支付保密费用。这是因为保密是基于劳动者对原单位商业秘密等负有法定的默示保密义务，是劳动者在劳动关系存续期间及离职后都应履行的基本责任。
约定竞业限制条款：
- 若保密协议中包含竞业限制条款，即规定劳动者在离职后的一定期限内（不得超过二年）不得从事与原单位有竞争关系的工作或自己开业生产、经营同类产品、从事同类业务，那么公司应当给予劳动者经济补偿。这是为了平衡劳动者因遵守竞业限制而可能遭受的经济损失。
二、相关法律法规的规定与补偿标准
《劳动合同法》第二十三条：
- 明确规定用人单位可以与劳动者在劳动合同或保密协议中约定保守商业秘密和与知识产权相关的保密事项，并可以约定竞业限制条款及经济补偿。这为保密协议及竞业限制条款的合法性提供了法律依据。
经济补偿标准：
- 如果保密协议或劳动合同中约定了竞业限制但未约定经济补偿，劳动者履行了竞业限制义务后，可以要求用人单位按照劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月平均工资的30%按月支付经济补偿。若月平均工资的30%低于劳动合同履行地最低工资标准，则按最低工资标准支付。
三、实际操作与建议
- 签署前仔细阅读：在签署保密协议前，劳动者应仔细阅读协议条款，特别是关于保密费用、竞业限制条款及经济补偿的部分，确保自己的权益得到保护。
- 明确补偿条款：如果保密协议中包含竞业限制条款，劳动者应与公司明确经济补偿的标准、支付方式及期限等，以避免后续纠纷。
- 法律途径维权：如遇公司未按照保密协议约定支付相关费用的情况，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益，比如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
四、特殊情况说明
- 公司未支付补偿金：若用人单位未按约定支付经济补偿金，劳动者有权选择不履行保密协议中的竞业限制义务，并可要求用人单位支付应得的经济补偿金。此情况下，用人单位可能面临法律纠纷及赔偿风险。
- 劳动者违反保密协议：若劳动者违反保密协议，泄露用人单位的商业秘密或违反竞业限制条款，则需按约定向用人单位支付违约金，并承担由此产生的法律责任。泄露商业秘密情节严重的，劳动者还可能面临民事赔偿、行政处罚乃至刑事责任。
总结：离职时签署了保密协议，公司是否应该给补偿并非一概而论，而是取决于保密协议的具体内容和相关法律法规的规定。劳动者在签署协议前应充分了解协议内容，并在必要时寻求我的法律帮助以确保自身权益。如果你有具体的保密协议或相关情况，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议。