爸爸跟女儿当然可以做亲子鉴定。亲子鉴定是一种通过科学手段来确定亲子关系的方法，它基于遗传学原理，通过比较被鉴定人的DNA序列来确定是否存在亲子关系。在法律上，亲子鉴定通常用于解决亲子关系的争议，如确认父子关系、母子关系等。

亲子鉴定的法律基础

亲子鉴定在法律上并没有特别的限制，只要符合法律规定的程序和条件，就可以进行。一般来说，亲子鉴定需要由具有合法资质的鉴定机构进行，并且需要遵循相关的鉴定程序和规范。

亲子鉴定的应用场景

1. 确认亲子关系：在存在亲子关系争议的情况下，如离婚诉讼中涉及子女抚养权、继承权等，亲子鉴定可以作为确认亲子关系的重要证据。
2. 上户口、移民等：在某些情况下，如上户口、移民等，可能需要提供亲子关系证明，亲子鉴定可以作为一种有效的证明方式。
3. 个人需求：除了法律需求外，个人出于好奇、确认血缘关系等目的，也可以选择进行亲子鉴定。

亲子鉴定的注意事项

1. 自愿原则：亲子鉴定应当遵循自愿原则，即被鉴定人应当自愿参与鉴定，不得强迫或欺骗。
2. 保护隐私：亲子鉴定涉及个人隐私，鉴定机构应当严格保护被鉴定人的隐私信息，不得泄露给无关第三方。
3. 合法资质：选择亲子鉴定机构时，应当确保其具有合法资质和良好的信誉，以保证鉴定结果的准确性和可靠性。

亲子鉴定的法律后果

如果亲子鉴定结果确认存在亲子关系，那么这一结果将作为法律上的证据，可能影响相关案件的判决结果，如抚养权、继承权等。如果亲子鉴定结果否认存在亲子关系，那么这一结果同样将作为法律上的证据，可能对相关当事人的权益产生影响。

总结与建议：爸爸跟女儿可以做亲子鉴定，但应当遵循自愿原则，选择具有合法资质的鉴定机构进行，并保护好个人隐私。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。