结论前置：
- 自离员工有权获得其实际工作期间的工资，用人单位不得无故克扣或拖欠。
- 若自离给用人单位造成经济损失，用人单位可要求赔偿，但赔偿与工资支付是两个独立的法律关系，不能以此为由拒绝支付工资。
详细分析：
一、自离员工工资支付的基本原则
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》第三十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一原则同样适用于自离员工。无论员工是主动离职还是自离，只要其在职期间正常付出了劳动，用人单位就应当按照双方约定的工资标准和实际出勤天数，为劳动者结算并支付相应的劳动报酬。
二、自离员工工资的计算方法
自离员工的工资应当根据其在用人单位的实际工作天数来确定，并按照劳动合同中约定的工资标准进行结算。用人单位在劳动者离职时，应当为其结清所有应得的工资，不得留有未结清的款项。例如，如果员工在自离前已经工作了半个月，那么用人单位就应当支付这半个月的工资。
三、自离员工工资支付的特殊情况与注意事项
经济损失赔偿：
- 若劳动者自离给用人单位造成了经济损失，如未按照正常流程交接工作导致公司业务受影响，用人单位有权要求劳动者赔偿经济损失。但这一要求与支付工资是两个不同的法律关系，不能以劳动者自离为由直接扣除其全部工资。
- 在要求劳动者赔偿时，需注意每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。否则，用人单位应按最低工资标准支付劳动者工资。
公司规章制度：
- 公司通常会在劳动合同或员工手册中明确规定关于自离的处理方式，包括是否享有工资待遇及如何计算等。这些内部规章制度虽基于公司管理需要而制定，但也需在法律框架内进行，不能违反相关法律法规对于劳动者权益的基本保障。
- 如果公司的规章制度中明确规定了自离员工不享有工资或需要扣除一定比例的工资，但这一规定违反了法律法规的强制性规定，那么该规定是无效的，用人单位仍需按照法律法规的规定支付劳动者工资。
四、自离员工工资支付的维权途径
协商：
- 首先，劳动者可以与用人单位进行协商，要求其支付应得的工资。在协商过程中，劳动者可以出示相关的工作记录、考勤记录等证据，以证明自己的工作情况和应得工资。
投诉与仲裁：
- 若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者直接提起劳动仲裁。劳动仲裁委员会将依法进行裁决，要求用人单位支付劳动者应得的工资。
诉讼：
- 对劳动仲裁结果不满意的，劳动者还可以向法院提起诉讼，通过司法途径来维护自己的合法权益。在诉讼过程中，劳动者需要提供充分的证据来证明自己的主张，如劳动合同、工资条、考勤记录等。
总结与建议：
自离员工有权获得其实际工作期间的工资，这是由法律法规明确规定的。用人单位在员工离职时，应遵守相关法律法规，确保工资支付的合法性和公平性。同时，劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取合适的维权措施来保护自己的合法权益。如果你作为自离员工遇到了工资支付问题，建议先与用人单位进行协商；协商无果的，可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁；对仲裁结果不满意的，还可以向法院提起诉讼。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。