根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及相关交通法规，以下交通违法行为会被扣除6分：
违反道路交通信号灯通行：
- 描述：在红灯亮起禁止通行时，机动车仍然继续行驶通过路口，即闯红灯。
- 分析：此行为严重破坏了交通信号灯的有序引导，容易导致路口交通混乱，增加碰撞事故的风险。例如，在繁忙的十字路口，如果一辆车闯红灯，很可能与正常行驶的车辆发生碰撞，造成交通事故。
机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车：
- 描述：驾驶证因违法等原因被交警部门暂扣后，仍驾驶机动车上路行驶。
- 分析：这是一种严重的违法行为，不仅危及道路交通安全，还可能面临更严厉的处罚。比如，驾驶证被暂扣期间驾车，一旦发生交通事故，保险公司可能拒绝赔偿，且驾驶员需承担全部责任。
超载与超员：
- 描述：包括驾驶货车载物超过核定载质量30%以上，或违反规定载客；驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数未达20%，或驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上。
- 分析：超载和超员都容易影响车辆操控性能和安全性，属于严重交通违法行为。例如，一辆核定载客5人的汽车，如果实际载客7人，就超过了核定人数的20%，将被扣6分。
超速行驶：
- 描述：涉及多种情况，如驾驶中型以上载客载货汽车、校车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达20%；或在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速20%以上未达到50%。
- 分析：超速行驶会显著增加交通事故的风险，特别是在恶劣天气或道路条件下。比如，在雨天或雾天，超速行驶更容易导致车辆失控，发生交通事故。
不按规定行驶：
- 描述：包括在低能见度气象条件下，驾驶机动车在高速公路上不按规定行驶；以及驾驶机动车不按照规定避让校车等。
- 分析：这些行为可能引发严重的交通事故，特别是在大雾、暴雨等低能见度情况下。例如，在大雾天气中，如果不按规定开启雾灯、降低车速，很容易与其他车辆发生碰撞。
非法占用应急车道：
- 描述：驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶。
- 分析：应急车道是供紧急情况车辆使用的专用车道，随意占用会影响救援等紧急行动。比如，在高速公路上发生交通事故时，如果应急车道被占用，救援车辆就无法及时到达现场，可能会延误救援时机。
高速公路违规停车：
- 描述：驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车。
- 分析：这种行为极易引发追尾事故，对高速公路的行车安全构成严重威胁。例如，在高速公路上随意停车，后车可能因来不及刹车而发生追尾事故。
特殊物品运输违规：
- 描述：包括运载超限的不可解体的物品未按指定的时间、路线、速度行驶或未悬挂明显标志；以及载运爆炸物品、易燃易爆化学物品及剧毒、放射性等危险物品未按指定要求行驶或未采取必要安全措施。
- 分析：这些行为增加了运输过程中的风险，可能对公共安全造成严重影响。比如，运输危险物品时如果不按规定行驶或未采取必要安全措施，一旦发生泄漏或爆炸等事故，后果将不堪设想。
以隐瞒、欺骗手段补领机动车驾驶证：
- 描述：通过不正当手段补领驾驶证。
- 分析：此行为破坏了驾驶证管理秩序，属于严重违法行为。比如，通过伪造证件或提供虚假信息补领驾驶证，一旦被发现将面临严厉的处罚。
疲劳驾驶：
- 描述：连续驾驶中型以上载客汽车、危险物品运输车辆以外的机动车超过4小时未停车休息或停车休息时间少于20分钟。
- 分析：疲劳驾驶容易导致驾驶人反应迟钝，危及行车安全。比如，长时间连续驾驶后，驾驶人的注意力会下降，反应速度会变慢，容易发生交通事故。
总结与建议：
驾驶员应严格遵守交通法规，确保行车安全。上述任何一项违法行为都将被扣除6分，并可能伴随其他处罚措施，如罚款、暂扣驾驶证等。为了自身和他人的安全，请务必遵守交通规则，文明驾驶。如果遇到交通违法相关的问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会为你提供专业的解答和建议。