结论前置：

1. 通常情况下，厂里旷工一天扣三天工资的做法是不合法的。这一做法违反了《劳动法》及相关法规中关于不得无故克扣或拖欠劳动者工资的规定。
2. 但在特定情况下，如果企业规章制度或劳动合同中有明确且合法的规定，且该规定经过了民主程序制定并公示，同时扣罚方式合理，那么可能具有一定的合法性。不过，即便如此，扣罚的合理性仍需接受司法实践的检验，且通常难以被认定为完全合理。

详细分析：

一、法律依据与劳动者权益

• 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保护劳动者劳动报酬权益的基本法律框架。
• 旷工一天，劳动者仅当天未提供劳动，因此用人单位最多只能不支付当天的工资。扣除三天工资的做法超出了合理范围，侵害了劳动者获取劳动报酬的权益。

二、企业规章制度的有效性

• 用人单位有权根据自身的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平，并通过规章制度对员工的考勤等进行管理。
• 但这些规章制度必须符合法律规定，经过民主程序制定（如与工会或职工代表平等协商确定），并向劳动者明确公示告知。如果规章制度未经这些程序，或内容违反法律规定，那么该规定对劳动者不具有法律效力。
• 即便规章制度经过了民主程序制定并公示，且内容不违反法律规定，但“旷工一天扣三天工资”的扣罚方式仍可能因过度惩罚而被视为不合理，从而在司法实践中难以得到支持。

三、经济损失与赔偿

• 如果劳动者旷工的行为给用人单位造成了实际经济损失，用人单位可以要求劳动者赔偿损失。
• 但这种赔偿应当基于实际损失的合理计算，并提供相应的证据支持。直接扣三天工资这种明显不合理的方式，难以被认定为是对实际损失的合理赔偿。
• 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

四、合法合理的处理方式

• 对于劳动者的旷工行为，用人单位应当依据公司的规章制度或劳动合同约定进行处理。
• 处理方式可以包括给予警告、记过、扣减绩效考核分数、扣减奖金等，但这些处理方式都应当在合法、合理、公正的范围内进行，不能违反国家法律法规的规定。
• 例如，用人单位可以规定旷工一天扣当天工资，或者根据旷工天数和情节严重程度，给予相应的纪律处分，但不应直接扣罚多天的工资。

五、劳动者的维权途径

• 如果劳动者认为用人单位的处理方式不合法或不合理，可以与用人单位协商解决。
• 协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，还可以依法提起诉讼。

综合建议：

• 用人单位在制定规章制度时，应确保其内容符合法律法规的要求，避免过度惩罚员工，以维护劳动关系的和谐稳定。
• 劳动者在遇到类似纠纷时，应了解自己的权益并采取适当的法律措施来维权。如果对法律条款或处理方式有疑问，可以直接向我咨询。
• 无论是用人单位还是劳动者，都应增强法律意识，遵守相关法律法规，共同营造一个公平、合理的劳动环境。