司机开车追尾且被认定为全责，给车主造成巨大损失时，赔偿问题主要依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任和合同违约的相关规定来处理。以下是具体赔偿方式和相关要点：

1. 赔偿范围
   司机需赔偿车主因事故产生的直接损失和合理间接损失：

   • 直接损失：包括车辆维修费用、车辆残值降低的损失（如事故导致车辆贬值）、车上物品损坏的赔偿等。
     
   • 合理间接损失：例如车主因车辆维修无法正常使用而产生的替代交通工具费用（如租车费）、误工费（若车主因处理事故或车辆维修导致收入减少）等。
     
   • 特殊情况：若车辆为营运车辆（如出租车、货车），司机还需赔偿停运期间的营运损失（需提供收入证明等证据）。

2. 赔偿主体

   • 司机本人：若司机是事故直接责任人，且无其他免责情形（如职务行为、雇佣关系等），需自行承担赔偿责任。
     
   • 保险公司：若司机购买了交强险和商业第三者责任险，保险公司需在保险限额内优先赔付。超出保险限额的部分，由司机自行承担。
     
   • 雇主或单位：若司机是在执行职务过程中发生事故（如为公司开车），根据《民法典》第1191条，雇主或单位需承担赔偿责任；司机存在重大过失的，雇主或单位可向其追偿。

3. 赔偿流程

   • 协商解决：车主可与司机或保险公司协商赔偿金额和方式，达成一致后签订书面协议。
     
   • 保险理赔：车主向司机所投保的保险公司报案，提交事故认定书、维修发票等材料，由保险公司定损并赔付。
     
   • 诉讼途径：若协商或保险理赔未果，车主可向法院起诉司机及保险公司，要求赔偿损失。诉讼中需提供事故认定书、维修记录、损失证明等证据。

4. 注意事项

   • 证据保留：车主应妥善保存事故认定书、维修发票、租车合同、收入证明等材料，以证明损失金额。
     
   • 诉讼时效：根据《民法典》第188条，向法院请求保护民事权利的诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。
     
   • 避免扩大损失：车主应及时维修车辆，避免因拖延导致损失扩大，否则扩大部分可能无法获得赔偿。

建议：若损失金额较大或涉及复杂情况（如车辆贬值、营运损失等），车主可委托专业律师协助处理，以确保赔偿金额合理且程序合法。如有进一步疑问，可直接向我咨询。