当土地被侵占时，您可以根据具体情况选择以下部门进行处理：

1. 向乡级人民政府或县级以上人民政府反映

   • 适用情况：这主要适用于单位之间的土地争议，或者个人与个人之间、个人与单位之间的土地所有权和使用权争议。
   • 处理方式：首先，您可以尝试与侵占者进行协商，看是否能达成和解。如果协商无果，您可以向乡级人民政府或者县级以上人民政府提出土地权属争议的申请。这些政府机构会组织相关部门进行调查，并根据调查结果进行调解或作出裁决。如果您对裁决结果不服，还可以在接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院提起诉讼。

2. 向自然资源主管部门举报

   • 适用情况：如果您发现有人未经批准非法占用土地进行建设，如搭建建筑物、构筑物等，这违反了土地管理法律法规。
   • 处理方式：您可以拨打全国统一的“12336”国土资源违法举报电话，或者前往当地自然资源主管部门的官方网站、微信公众号等平台进行举报。自然资源主管部门会对举报内容进行调查核实，并根据调查结果采取相应的处理措施，如责令停止违法行为、限期改正、没收违法所得、罚款等。

3. 向农业农村主管部门投诉

   • 适用情况：这主要适用于涉及农村土地承包经营权纠纷的情况，如承包地被他人侵占用于非农业用途等。
   • 处理方式：您可以向当地农业农村主管部门（如农业农村局）投诉。农业农村主管部门会根据相关法律法规和政策规定，对投诉事项进行调查处理，以维护您的合法权益。

4. 向公安机关报案

   • 适用情况：如果土地侵占行为涉嫌犯罪，如非法占用农用地罪等，这已经超出了民事纠纷的范畴。
   • 处理方式：在这种情况下，您应及时向当地公安机关报案。公安机关会依法立案侦查，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

在处理土地被侵占问题时，您还需要注意以下几点：

• 确认土地权属：首先，您需要明确土地的权属关系，查看是否有合法的土地使用权证书或其他相关证明文件。这是后续维权的基础。
• 收集证据：包括现场照片、视频、证人证言等，以证明土地被侵占的事实。这些证据在后续处理过程中将起到关键作用。
• 保持冷静和理性：在整个维权过程中，务必保持冷静和理性，严格遵循法律程序。不要采取过激行为或私自解决，以免引发更大的纠纷或法律责任。

最后，我想强调的是，土地被侵占是一个复杂的问题，可能涉及多个法律领域和部门。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供更具体的法律指导和支持。