在自己宅基地上建房，后面邻居不让留窗户是否合法，这主要取决于窗户的开设是否侵犯了邻居的合法权益，尤其是采光权和隐私权。以下从几个方面进行详细分析：

1. 采光权：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。其中，采光权是相邻权的重要组成部分。
   • 如果您开设的窗户并未对邻居的采光造成实质性影响，或者即使有影响但并未达到法律规定的“严重妨碍”程度，那么邻居无权阻止您留窗户。
   • 反之，如果窗户的开设导致邻居房屋的采光受到严重影响，且这种影响超出了正常容忍范围，那么邻居有权要求您采取措施消除影响，甚至可能通过法律途径维护自己的权益。

2. 隐私权：

   • 隐私权是每个人的基本权利之一，受到法律保护。如果您开设的窗户正对邻居的卧室、浴室等私密空间，且未采取任何遮挡措施，那么可能构成对邻居隐私权的侵犯。
   • 在这种情况下，邻居有权要求您关闭窗户或采取其他措施保护其隐私。

3. 地方性法规和规划要求：

   • 除了上述法律原则外，不同地区可能还有关于农村宅基地建房的具体规定和规划要求。这些规定可能涉及房屋的高度、间距、窗户开设位置等方面。
   • 因此，在决定是否留窗户时，您还需要考虑当地的具体规定和规划要求，确保自己的建房行为符合法律法规。

建议：

• 在建房前，最好与邻居进行充分沟通，了解他们的意见和担忧，并尽量协商达成一致。
• 如果无法协商一致，您可以咨询当地规划部门或法律专业人士，了解具体的法律法规和规划要求，确保自己的建房行为合法合规。
• 如果邻居的阻止行为已经构成对您的合法权益的侵犯，您可以通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼等。

总之，在自己宅基地上建房留窗户是否合法，需要综合考虑采光权、隐私权以及地方性法规和规划要求等多个方面。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。