在起诉对方公司时，一般应当起诉公司本身，而非其法定代表人。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律主体角度
公司作为独立法人：根据《中华人民共和国公司法》及相关法律规定，公司是具有独立法人资格的民事主体，能够以自己的名义从事民事活动，并承担相应的民事责任。因此，当公司侵犯他人权益或违反合同约定时，受害人或合同相对方有权直接起诉公司，要求其承担法律责任。
法定代表人的角色：法定代表人作为公司的代表，其职责是代表公司行使职权、履行义务。在民事诉讼中，法定代表人通常作为公司的诉讼代表人参与诉讼，但并非诉讼的被告。除非法定代表人个人存在违法行为或与公司共同侵权，否则一般不对公司债务或违法行为承担个人责任。
二、诉讼实践角度
起诉公司的便利性：起诉公司通常更为直接和便利，因为公司的相关信息（如名称、住所、法定代表人等）在工商登记部门均有备案，易于查询和确认。此外，公司作为被告，其财产和责任范围相对明确，有利于判决的执行和赔偿的实现。
起诉法定代表人的限制：除非有充分证据证明法定代表人个人存在违法行为或与公司共同侵权，否则起诉法定代表人可能面临诸多困难。例如，需要证明法定代表人个人与公司行为之间的关联性、法定代表人个人的过错程度等，这些都需要较高的举证成本和法律风险。
三、特殊情况下的考虑
法定代表人个人责任：在某些特殊情况下，如法定代表人利用公司名义进行个人犯罪活动、与公司财产混同导致公司丧失独立法人资格等，受害人或合同相对方可以同时起诉公司和法定代表人，要求其承担连带责任。但这种情况需要充分的证据支持，并符合相关法律规定。
公司注销或吊销后的处理：如果公司已经注销或被吊销营业执照，但尚未完成清算程序或存在未了结的债务，受害人或合同相对方可以起诉公司的股东、董事或实际控制人等责任主体，要求其承担相应的法律责任。但这种情况下的被告选择需要根据具体案情和法律规定进行判断。
四、法律建议
明确被告身份：在起诉前，应明确被告的身份和法律地位，确保起诉对象的准确性。如果对公司或法定代表人的法律责任存在疑问，可以咨询专业律师进行法律分析和判断。
收集充分证据：无论起诉公司还是法定代表人，都需要收集充分的证据来支持自己的主张。证据应包括合同、交易记录、沟通记录、证人证言等，以证明对方存在违法行为或违约行为。
遵循法律程序：在起诉过程中，应遵循法律程序和规定，确保诉讼的合法性和有效性。如果需要申请财产保全、证据保全等措施，应及时向法院提出申请并按照要求提供担保。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。