结论前置：自动离职扣几天工资并没有一个固定的答案，具体扣除情况需根据实际情况、用人单位的规章制度以及劳动合同的约定来确定，但无论如何扣除，都需确保合法合理，不得使劳动者实际所得低于当地最低工资标准。

一、自动离职工资计算的基本原则

1. 实际用工天数计算：员工自动离职时，其工资应当按照实际工作的天数来计算，这是确保员工获得与其付出劳动相对应的工资报酬的基本原则。

2. 不得无故克扣工资：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。因此，用人单位在劳动者自动离职时，应结清其应得的工资，除非存在合法合规的扣除理由。

二、合法扣除工资的情形及标准

1. 经济损失赔偿：

   • 如果劳动者自动离职给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求劳动者承担赔偿责任。赔偿可以从劳动者的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。这一规定依据的是《工资支付暂行规定》第十六条。

2. 旷工扣减：

   • 如果员工在离职前存在旷工行为，用人单位可以按照旷工日数扣减相应的工资，通常是日工资数乘以旷工天数。但同样需要确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。

三、用人单位规章制度与劳动合同的约定

1. 规章制度：用人单位应在规章制度中明确扣除工资的要求和标准，并公开公示告知员工。这些规定必须符合劳动法的相关规定，不能随意剥夺员工的劳动报酬。例如，有些公司可能规定旷工一天扣一定比例的薪资，但这些扣罚必须在法律允许的范围内进行。

2. 劳动合同：劳动合同是劳动者与用人单位之间的法律约束文件，其中可能包含关于自动离职或旷工的特别约定。劳动者在签订劳动合同时应仔细阅读相关条款，了解自己的权利和义务。如果劳动合同中的约定与劳动法相冲突，应以劳动法为准。

四、特殊情况下的处理

1. 试用期自动离职：试用期员工自动离职时，同样需要按照实际用工天数计算工资，并遵守上述扣除原则和标准。

2. 未签订劳动合同的情况：如果用人单位未与劳动者签订劳动合同，但存在实际的用工行为，即视为建立了劳动关系。此时，用人单位同样不能随意克扣劳动者工资，且自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，还需向劳动者每月支付二倍的工资作为赔偿。

五、劳动者权益保护

• 如果用人单位以自动离职为由不合理地克扣大量工资，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者应提供相关证据，如工资条、考勤记录等，以证明自己的主张。

举例说明：假设小李在某公司工作，月工资为5000元，因个人原因自动离职，且离职前旷工了2天。如果公司规章制度规定旷工一天扣日工资的200%（假设日工资为5000元/21.75天≈230元，则旷工一天扣460元，但此规定可能因过高而不合法，实际应调整为合法比例），但按照法律规定，每月扣除的部分不得超过当月工资的20%，即最多扣除1000元。如果小李旷工2天，按照合法比例扣除（假设按日工资的100%扣除，即每天230元），则应扣除460元，扣除后工资为4540元，仍高于当地最低工资标准，因此是合法的。但如果公司规章制度规定扣除过多，导致小李实际所得低于最低工资标准，则此行为违法。

综上所述，自动离职扣工资的问题需要根据具体情况和法律法规来确定。用人单位应依法行事，确保工资扣除的合法性和合理性；劳动者也应了解自己的权益，必要时采取法律手段维护自身利益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。