结论前置：在交通事故中，营运车辆被扣确实有权主张停运费。停运费是营运车辆因事故维修等合理期间内无法从事正常运营活动所遭受的收入减少，属于因事故导致的间接损失，应按照责任比例由对方分担。

详细分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百八十四条，侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。营运车辆因事故等侵权行为导致停运，其停运期间的合理损失明确属于财产损失范畴。
   • 最高人民法院《关于交通事故中的财产损失是否包括被损车辆停运损失问题的批复》及《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条均明确规定，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。

2. 停运费的具体确定因素：

   • 停运时间：计算从事故发生导致车辆无法正常运营起，至车辆修复并恢复正常营运之日止的时间段。这通常需要通过维修厂的维修记录、维修发票上的时间等相关证据来证明。
   • 营运收入：为确定合理的停运损失，需明确车辆正常营运时的收入情况。通常参考停运前一段时间（如几个月或一年）的营运收入流水、合同订单等来计算平均每日或每月的营运利润。若缺乏直接证据，法院可能会参考同地区、同类型营运车辆的平均收入水平进行酌定。

3. 索赔注意事项：

   • 在主张停运损失赔偿时，受害人需提供充分证据，包括但不限于营运收入的证明材料、车辆维修时间证明等，以清晰展示停运损失的具体数额。
   • 若双方对赔偿金额无法达成一致，可通过诉讼等法律途径解决，法院将根据具体案件情况进行认定和判决。
   • 保险公司可能不赔偿停运损失（视为间接损失），赔偿责任可能落在肇事司机身上。因此，在申请赔偿时，需及时通知保险公司并保留好相关证据，以便必要时通过法律途径维护自身权益。

4. 特殊情况处理：

   • 如果营运车辆在事故中负主要责任，仍有权主张停运费，但应按照责任比例由对方（次要责任方）分担。
   • 若对方车辆有保险，保险公司也需在责任限额内进行赔付。具体来说，交强险需在无责限额内进行赔付，而商业三者险则需依据合同条款来确定是否给予赔偿。

举例说明： 假设一辆营运货车在交通事故中受损，需要维修10天。该货车在停运前一年的平均每日营运利润为500元。那么，该货车因事故导致的停运损失就是500元/天 × 10天 = 5000元。如果事故责任在对方，那么这5000元就应由对方承担赔偿责任。

建议： 在处理此类案件时，建议您保留好相关证据，如营运合同、收入流水、维修记录等，以便证明自己的损失和侵权行为的因果关系。同时，及时咨询专业律师，了解具体的赔偿流程和注意事项，以便更好地维护自己的合法权益。

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