当注销公司时遇到其中一个股东不愿意配合的情况，你可以通过以下步骤和法律途径来妥善处理：

1. 初步沟通与协商

   • 目的与重要性：首先，尝试与不愿意配合的股东进行友好沟通，了解其具体反对原因。通过协商，寻求双方都能接受的解决方案，这是最为和谐且成本较低的方式。
   • 沟通内容：在沟通中，可以讨论公司资产分配、债务承担等关键问题，确保各股东利益得到合理保障。同时，强调注销公司的必要性和紧迫性，争取该股东的理解和支持。

2. 依据公司章程与法律法规推进

   • 查看公司章程：公司章程通常对公司解散、清算等事项有明确规定。检查章程中是否明确了注销条件，如经代表一定比例表决权的股东通过等。若达到该条件，即便有个别股东不同意，也可依据章程启动注销程序。
   • 法定条件：根据《公司法》规定，当公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，且通过其他途径不能解决时，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东可请求人民法院解散公司。法院判决解散后，公司需进入清算程序，最终完成注销。

3. 书面通知与股东会决议

   • 书面通知：向不配合的股东发出书面通知，明确规定配合的期限和义务。保留通知的送达凭证，如快递回执、电子邮件确认等，作为后续可能的法律证据。
   • 股东会决议：在符合法定程序和条件的情况下，召集股东会形成多数股东同意注销公司的决议。决议中可包含对不配合股东采取的限制权利等措施，如限制其分红权、表决权等。

4. 法律途径与其他策略

   • 提起诉讼：若协商无果，且该股东的行为严重阻碍了公司注销进程，可根据公司章程及相关法律法规向法院提起诉讼，请求法院判令不配合的股东履行义务。在准备诉讼时，需收集充分的证据证明股东不配合的事实及对公司的不利影响。
   • 股权转让：考虑由其他股东或第三方收购不配合股东的股权，以消除阻碍。股权收购价格可通过协商确定或由专业评估机构评估定价。在股权转让过程中，需确保转让程序合法合规，避免产生新的纠纷。
   • 破产清算：若公司符合破产条件，且股东既不愿配合注销也不愿接受股权转让，你可以作为债权人向法院提出破产申请，进入破产清算程序。清算结束后，依法予以注销。

5. 注销程序的合法合规性

   • 无论股东是否同意，公司注销程序必须严格按照法律法规和公司章程的规定进行。这包括依法通知债权人、进行清算、公告等一系列法定程序。
   • 保留好相关文件和记录，如清算报告、股东会决议、公告剪报等，以备后续可能出现的争议之需。

总结与建议：

• 在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，通过协商、法律途径等多种方式综合施策，尽可能维护各方利益。
• 确保所有操作均符合法律法规和公司章程的规定，避免法律风险。若对具体操作流程或法律条款有疑问，可直接向我咨询。
• 最终目标是确保公司注销程序的合法合规进行，保护公司和股东的合法权益。在整个过程中，保持与所有股东的沟通透明和及时，有助于减少误解和冲突。