厂房改公寓出租的合法性主要取决于是否满足相关法律法规的要求，包括城乡规划、土地使用、建筑安全、消防安全以及行政审批等多个方面。未经合法程序和获得相关批准擅自进行改造并出租是违法的。
一、合法性的判断依据
符合城乡规划与土地使用规定：
- 厂房改公寓的首要前提是必须符合当地的城市规划和土地使用规定。根据《中华人民共和国城乡规划法》，若需变更土地用途或建筑物使用功能（如从工业转为居住），必须向城乡规划主管部门提出申请，并经审查批准后办理相关规划变更手续。这意味着，只有在城市规划允许且获得正式许可的情况下，改造才可能被视为合法。
- 同时，还需考虑土地性质是否允许转变。若厂房土地性质为工业用地，需转变为居住或商服用地，这通常涉及补缴土地出让金差价和办理土地性质变更手续。
建筑结构与安全标准：
- 改造后的公寓必须符合建筑质量和安全标准。这包括对厂房原有结构进行评估和加固，确保满足居住功能的承载要求，如抗震、防火、隔音和结构稳定性等方面。
- 改造过程中还需完善各类配套设施，如给排水、供电、供气、通信等基础设施，以及公共活动空间、停车位等，确保居住环境的舒适性和安全性。
消防安全要求：
- 改造后的公寓必须符合消防安全要求，通过消防部门的审核验收，取得消防许可。这包括消防设施的配备与调整，以满足居住建筑的消防要求，以及逃生通道的设置等。
行政审批手续：
- 改造项目需经过多部门联合审批，包括但不限于规划、住建、消防和环保等部门。具体流程包括向规划部门提出功能变更申请，住建部门审查改造设计方案，消防部门审核消防设计，环保部门评估环境影响等。
- 未经这些部门审批，或未获得所有必要批准即擅自改造并出租，属于违法行为。
二、不合法的情况及后果
违反规划用途：
- 若所在区域规划明确禁止将厂房改为公寓，或未获得规划部门批准擅自改变土地用途和建筑物使用功能的，将构成违法建设行为。相关部门有权责令停止施工、恢复原状，甚至依法予以拆除，并处以相应的罚款。
消防及安全隐患：
- 若改造后的建筑未达到居住建筑的消防及安全标准，存在严重安全隐患的，相关部门同样有权责令整改，直至达到安全标准为止。在极端情况下，也可能面临被拆除的风险。
未履行法定程序：
- 未经规划、建设、消防等部门审批，或未获得有利害关系业主同意（如厂房位于住宅小区内）即擅自改造并出租的，属于违法行为。一旦被发现，将被要求停止经营并恢复房屋原状，还可能面临法律责任。
三、合法改装的途径与建议
了解并遵守相关法律法规：
- 在进行厂房改公寓的改造前，务必充分了解并遵守当地的城市规划、土地使用、建筑安全、消防安全以及行政审批等方面的法律法规。
咨询当地政府部门：
- 向当地规划、住建、消防等部门咨询具体的政策要求和审批流程，确保改造计划合法合规。
办理相关手续：
- 按照相关部门的要求，提交详细的改造方案和证明材料，依法申请用途变更、建设审批、消防审核等手续。
获得批准并告知相关方：
- 获得所有必要批准后，方可进行改造，并及时告知物业服务企业、有利害关系的业主等相关方，确保改造过程合法合规且不影响他人权益。
总结来说，厂房改公寓出租是一个涉及多方面法律法规和政策要求的复杂过程。在进行此类改造前，请务必确保改造的合法性和安全性，并遵循相关法律法规和政策要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。