生产企业使用已过期的ISO9001认证，可能面临行政处罚、合同违约风险及声誉损害等后果，具体如下：

1. 行政处罚风险
   根据《中华人民共和国认证认可条例》第六十七条，企业若在认证证书有效期届满后未申请延续使用，或被撤销、注销后仍继续使用认证标志，市场监管部门可责令改正，并处3万元以下罚款。若企业伪造、冒用认证标志，处罚力度可能升级至5万元以上20万元以下罚款，并没收违法所得。
   关键点：处罚依据是“无证使用”或“违规使用标志”，而非证书过期本身，但过期未续证通常会被认定为无证状态。

2. 合同违约风险
   若企业与采购方、合作伙伴的合同中明确约定需持有有效ISO9001认证，使用过期证书可能构成违约。对方有权要求企业承担违约金、赔偿损失，甚至解除合同。例如，在招投标项目中，过期证书可能导致中标无效或被列入失信名单。

3. 声誉与市场风险
   过期证书被曝光后，可能引发客户信任危机，导致订单流失。部分行业（如医疗器械、食品）对质量管理体系要求严格，违规使用证书可能触发行业自律处罚，如暂停会员资格、公开通报等。

建议行动方案：

1. 立即停用过期证书及标志，避免处罚扩大化；
   
2. 尽快申请证书复审或重新认证，恢复合规状态；
   
3. 审查合同条款，评估违约风险并主动与合作伙伴沟通；
   
4. 完善内部管理，建立证书有效期监控机制，防止再次过期。
   

若企业已收到监管部门通知或面临诉讼，可进一步提供具体情节，我将协助分析证据链及应对策略。