针对“铁路职工严重违章怎么处理”这一问题，我们可以从法律和规章制度两个层面进行详细解答。

一、法律层面

根据《中华人民共和国刑法》第一百三十二条的规定，铁路职工如果违反规章制度，导致铁路运营安全事故发生，并造成严重后果的，将面临刑事处罚。具体来说：

• 如果造成严重后果，铁路职工可能被处三年以下有期徒刑或者拘役；
• 如果造成特别严重后果，如人员伤亡、重大财产损失或长时间中断行车等，铁路职工可能被处三年以上七年以下有期徒刑。

以典型案例为例，某铁路职工在监护道口作业时，违反相关规章制度，未及时关闭道口拦门，导致一辆货车与货运列车相撞，造成一人死亡、一人轻伤，并造成直接经济损失和铁路行车中断。该职工因此被判处有期徒刑一年，这就是对铁路职工严重违章行为的法律制裁。

二、规章制度层面

除了法律制裁外，铁路部门还有一套完善的规章制度来处理铁路职工的严重违章行为。这主要体现在《铁路交通事故调查处理规则》中，该规则对铁路交通事故的调查处理、责任追究等方面进行了详细规定。

1. 事故调查：一旦发生铁路运营安全事故，铁路部门会立即启动事故调查程序，查明事故原因、性质和责任。

2. 责任追究：根据事故调查结果，铁路部门会对相关责任人进行责任追究。对于严重违章的铁路职工，可能会面临警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等行政处分，甚至可能被追究刑事责任。

3. 整改措施：铁路部门还会根据事故调查结果，制定并落实整改措施，以防止类似事故再次发生。这包括加强安全培训、完善安全管理制度、强化安全监管等。

三、综合处理建议

对于铁路职工的严重违章行为，除了依法进行法律制裁和规章制度处理外，铁路部门还应采取以下措施：

• 加强安全培训：提高铁路职工的安全意识和操作技能，确保他们能够严格遵守规章制度。
• 完善安全管理制度：科学合理地制定规章制度，明确责任分工和操作流程，确保铁路运营安全。
• 强化安全监管：加大对铁路运营安全的监管力度，及时发现和纠正违章行为，防止事故发生。

综上所述，铁路职工严重违章行为将受到法律的严厉制裁和规章制度的严肃处理。铁路部门应加强安全培训、完善安全管理制度、强化安全监管，以确保铁路运营安全。