农民工辞职后，确实有权要求用人单位结清工资。这一权益不仅受到《中华人民共和国劳动法》的明确保护，也体现在《工资支付暂行规定》的具体条款中。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：该条款明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠。这意味着，无论农民工是主动辞职还是被动离职，用人单位都有义务按时足额支付其工资。

2. 《工资支付暂行规定》第九条：该条款进一步规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定为农民工在辞职时要求结清工资提供了直接的法律依据。

二、实际操作流程

1. 协商要求：农民工在依法办理离职手续后，应首先与用人单位进行协商，明确要求立即结清工资。这是维护自身合法权益的第一步，也是最为直接和有效的方式。

2. 合同约定：如果双方签订了劳动合同，并且合同中有关于工资支付时间的明确约定，那么双方应当按照合同的约定来执行。但需要注意的是，合同约定不得违反法律法规的强制性规定，如不得约定离职后长时间内才支付工资等。

3. 结清标准：工资结清的标准应按照农民工的实际出勤天数及月工资标准进行核算，包括加班工资、奖金、津贴等所有应得收入。

三、法律救济途径

如果用人单位无故拖欠或拒绝支付工资，农民工可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

1. 协商：首先尝试与用人单位进行友好协商，要求立即支付工资。在协商过程中，可以明确指出相关法律法规的规定，以增强说服力。

2. 投诉举报：如果协商无果，农民工可以向当地劳动监察部门投诉举报，寻求政府的帮助和支持。劳动监察部门将依法对用人单位的违法行为进行调查处理，并督促其支付拖欠的工资。

3. 法律程序：如果协商和投诉均未能解决问题，农民工可以申请劳动仲裁或提起诉讼。通过法律途径来追讨被拖欠的工资，是维护自身合法权益的最后一道防线。在申请劳动仲裁或提起诉讼时，农民工需要提供充分的证据来证明自己的主张，如劳动合同、工资条、考勤记录等。

四、注意事项

1. 保留证据：农民工在平时工作中应注意保留相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等。这些证据在维权过程中将起到至关重要的作用。

2. 及时维权：一旦发现用人单位有拖欠工资的行为，农民工应及时采取措施进行维权。拖延时间可能会导致证据丢失或维权难度增加。

综上所述，农民工辞职后有权要求用人单位结清工资，这是其法定权益。在实际操作中，农民工应充分了解自己的法律权益，积极运用法律武器来维护自身的合法权益。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，切实履行好支付工资的法律责任。