营运车辆的停运损失，主要由事故责任方来承担。不过，具体责任分配和赔偿方式需依据交强险、商业三者险的保险条款以及相关法律规定来确定。下面我将从多个角度为您详细分析：
一、保险公司赔偿情形
交强险赔偿
- 赔偿依据：根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，合理的停运损失可被视为财产损失的一部分。虽然交强险条款通常将间接损失列为除外责任，但部分法院在司法实践中会认为合理的停运损失属于交强险财产损失赔偿范围。
- 赔偿范围：交强险有责任财产损失赔偿限额为2000元，无责任财产损失赔偿限额为100元。符合规定的停运损失在此限额内可获得赔偿。
商业三者险赔偿
- 一般情况：商业三者险合同条款常明确约定停运损失等间接损失为免赔范围。若保险公司已履行提示和明确说明义务，则不承担停运损失的赔偿责任。
- 未履行提示说明义务：若保险公司未能证明其已就免责条款向投保人履行提示和明确说明义务，则该免责条款无效，保险公司需在商业三者险责任限额内赔偿停运损失。
二、侵权人赔偿情形
- 保险公司免赔：当保险公司依据保险合同条款对停运损失免责时，侵权人作为直接责任方，应对营运车辆的合理停运损失承担赔偿责任。
- 超出保险限额：若停运损失超出交强险和商业三者险的赔偿限额，超出部分由侵权人承担。
- 双方都有责任：若交通事故双方均有责任，则停运损失应按各自的责任比例分担。例如，如果双方各负50%的责任，那么停运损失也应由双方各承担50%。
三、特殊情形
- 雇员侵权：根据《中华人民共和国民法典》规定，若侵权人在执行工作任务过程中发生交通事故导致营运车辆受损并产生停运损失，由用人单位承担侵权责任。用人单位承担后，可向有故意或重大过失的工作人员追偿。
- 挂靠经营：以挂靠形式从事道路运输经营的机动车发生交通事故造成损害且属于该机动车一方责任的，挂靠人和被挂靠人应承担连带责任，共同赔偿营运车辆的停运损失。
四、建议与总结
- 保留证据：在处理此类案件时，营运车辆的车主应保留好相关证据，如维修记录、停运时间证明、收入证明等，以便在索赔时提供有力支持。
- 及时咨询：由于停运损失赔偿问题涉及多个法律领域和复杂的保险条款，建议车主在事故发生后及时咨询专业律师，以确保自身权益得到充分维护。
- 理性维权：在索赔过程中，车主应保持理性，通过合法途径维护自己的权益，避免采取过激行为导致不必要的法律纠纷。
综上所述，营运车辆的停运损失赔偿需综合考虑交强险、商业三者险的保险条款以及相关法律规定。如果您在处理此类案件时遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。