“三跨三分离”案件，通常指的是涉及跨地区、跨部门、跨行业，以及人事分离、人户分离、人事户分离的复杂矛盾纠纷。这类案件由于涉及多个地域、部门和行业，往往存在对接难、处理难、调解难等问题。针对这类案件，以下是一些处理建议：

一、主动介入，明确责任主体

1. 属地管理原则：根据“属地管理、分级负责，谁主管、谁负责”的原则，明确发生矛盾纠纷的镇、村（居）或单位为总牵头单位，负责整体协调和推进。
2. 明确化解主体：有权处理此矛盾纠纷的单位是化解主体责任单位，应主动承担起调解和解决问题的责任。
3. 稳控主体责任：当事人户籍地所属镇、村（居）是稳控主体责任单位，需做好当事人的稳控工作，防止矛盾激化。若当事人户籍地与居住地不一致，居住地所属镇、村（居）应协助做好稳控。

二、源头介入，加大排查力度

1. 全面摸底排查：组织对所有“三跨三分离”矛盾隐患进行全面摸底排查，确保不遗漏任何潜在问题。
2. 分类建立台账：根据矛盾隐患的性质、类型等，将排查范围分为跨省类、跨市类、跨镇类，以及涉法涉诉类和非涉法涉诉类等，建立个案台账。
3. 分析研判：对排查出来的矛盾纠纷进行认真分析研判，全面掌握重点矛盾，明确解决途径和方法，为后续调解工作提供有力支持。

三、联动介入，开展调处协作

1. 建立信息对接机制：加强与事发地、相关部门和行业的沟通联系，建立信息对接机制，确保信息畅通无阻。
2. 权益保障联动：建立权益保障联动机制，确保当事人在调解过程中的合法权益得到充分保障。
3. 重大事项会商会办：对于重大、疑难、复杂纠纷，建立重大事项会商会办机制，组织相关部门和专家进行会商，共同研究解决方案。
4. 联合调处：对重大、疑难、复杂纠纷，由两地市、镇、村三级调解组织共同委派调解员进行联合调处，实现职能互补、资源共享，提高调解效率和质量。

四、具体案例借鉴

以宝兴县和泰兴市的处理经验为例，它们都通过主动介入、明确责任、源头排查、联动调处等方式，成功化解了多起“三跨三分离”矛盾纠纷。例如，宝兴县综治中心通过“三真换三真”工作法（真心换真心、真情换真情、真金换真息诉息访），与事发地建立联动协作机制，成功化解了一起因工伤维权产生的矛盾纠纷。泰兴市司法局则通过明确化解时限、加大排查力度、开展调处协作等措施，有效化解了跨市以上的纠纷和市内跨乡镇的矛盾纠纷。

五、持续跟进与反馈

在调解过程中，应持续跟进案件进展，及时与当事人和相关单位沟通联系，确保调解工作顺利进行。调解结束后，还应及时收集反馈意见，总结经验教训，为后续调解工作提供参考和借鉴。

综上所述，“三跨三分离”案件的处理需要主动介入、明确责任、源头排查、联动调处以及持续跟进与反馈等多方面的努力。希望这些建议能对您有所帮助。