关于电瓶车闯红灯罚款50元是否合法的问题，这主要取决于电瓶车是否属于机动车范畴以及当地的交通管理规定。以下是对此问题的详细解析：

一、非机动车范畴的电瓶车闯红灯处罚

对于符合非机动车标准的电瓶车，闯红灯是违反《中华人民共和国道路交通安全法》的行为。根据该法第八十九条，非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将处警告或者5元以上50元以下罚款。因此，如果电瓶车被认定为非机动车，且当地执法部门根据具体情况确定了50元的罚款金额，那么这一处罚是合法的。在实际执法中，不同地区可能会根据交通状况、违法行为严重程度等因素，在法律规定的罚款幅度内确定具体的罚款金额。

二、机动车范畴的电瓶车闯红灯处罚

若电瓶车达到机动车标准（如电动摩托车），则其闯红灯的处罚将依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条进行，即机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的，将处警告或者20元以上200元以下罚款，并记6分。在这种情况下，如果电瓶车被认定为机动车，而罚款金额仅为50元且未记分，那么这一处罚可能并未完全按照机动车的标准执行，但具体是否合法还需结合当地交通管理规定和执法实践来判断。不过，通常来说，对于机动车范畴的电瓶车闯红灯，罚款金额可能会更高，并伴随记分处罚。

三、地区差异与特殊情况

1. 地区差异：不同地区对电瓶车闯红灯的处罚力度可能存在差异。一些地区可能根据当地的交通状况、违法行为严重程度等因素，对罚款金额进行了适当调整。因此，在判断罚款50元是否合法时，还需考虑当地的交通管理规定和执法实践。

2. 特殊情况：如果电瓶车闯红灯引发了交通事故，闯红灯方通常需承担相应的事故责任，包括赔偿事故导致的人身伤害和财产损失。在这种情况下，罚款金额可能会因事故责任的划分而有所调整。

四、建议与总结

1. 了解当地规定：电瓶车驾驶人应了解并遵守当地的交通管理规定，特别是关于电瓶车闯红灯的处罚标准。

2. 严格遵守交通规则：无论电瓶车是否属于机动车范畴，驾驶人都应严格遵守交通规则，确保行车安全。闯红灯不仅威胁自身和他人的安全，还会面临相应的法律处罚。

3. 及时缴纳罚款：如果因闯红灯被罚款，应及时缴纳罚款以避免产生滞纳金、影响个人信用记录及驾驶证申领等严重后果。

综上所述，电瓶车闯红灯罚款50元是否合法取决于电瓶车是否属于机动车范畴以及当地的交通管理规定。如果电瓶车被认定为非机动车，且当地执法部门根据具体情况确定了50元的罚款金额，那么这一处罚是合法的。如果电瓶车被认定为机动车，则罚款金额和记分处罚可能需按照机动车的标准执行。无论如何，电瓶车驾驶人都应严格遵守交通规则，确保行车安全。