员工自离不发工资是违法的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一规定明确指出了用人单位必须按时足额支付劳动者工资，不得以任何理由克扣或拖欠。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这进一步强调了用人单位支付工资的义务。

3. 《工资支付暂行规定》第九条：劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，无论员工以何种方式离职，用人单位都应支付其应得的工资。

二、违法性分析

1. 工资支付与离职方式无关：员工自离虽然可能违反了公司的规章制度或劳动合同的约定，但这并不构成用人单位不支付工资的理由。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，与劳动者的离职方式无关。

2. 未办理离职手续不影响工资支付：即使员工未按照公司规定办理离职手续，用人单位也不能以此为由拒绝支付工资。因为工资支付是基于劳动关系和劳动付出，而非离职手续的完成情况。

3. 经济损失赔偿与工资支付区分：如果员工自离给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求员工赔偿经济损失。但这一赔偿与支付劳动者应得工资是两个不同的法律关系，不能混为一谈，也不能以此为由拒绝支付工资。经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。

三、劳动者权益与维权途径

1. 劳动者权益：劳动者有取得劳动报酬的权利，这是受法律保护的。即便是自动离职，对于已经付出劳动的部分，用人单位也应按照约定支付相应工资。

2. 维权途径：

   • 协商：首先尝试与公司协商解决，向公司说明其做法的违法性，要求支付工资。
   • 投诉：若协商不成，可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资。
   • 劳动仲裁与诉讼：申请劳动仲裁是另一种有效的维权方式。在仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等）以证明自己的工作情况和应得工资数额。若对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。

四、特殊情况处理

尽管公司有义务支付员工工资，但在某些特殊情况下，如员工自离给公司造成重大经济损失，且公司有充分证据证明该损失与员工自离行为有直接因果关系，公司可以按照劳动合同的约定或相关法律法规的规定，要求员工进行赔偿。但这一赔偿应在合法合理的范围内进行，且不能以此为由拒绝支付员工应得的工资。

总结与建议：员工自离后，公司应当依法支付其应得的工资。如果公司违反这一规定，员工有权通过法律途径来维护自己的合法权益。同时，建议公司在处理员工自离问题时，应遵循相关法律法规和劳动合同的规定，妥善处理工资支付事宜，避免不必要的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。