结论：骑电动自行车在一个路口被抓拍三次是否违法，需根据具体情况判断，若三次抓拍均对应不同的违法行为，则均可能构成违法；若仅因同一违法行为被多次抓拍，则一般不应重复处罚。以下从不同角度详细分析：
一、同一违法行为多次抓拍的情况
法律原则：
- 根据《行政处罚法》的相关规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。这一原则被称为“一事不再罚”原则，旨在防止行政机关对同一违法行为进行重复处罚，保护当事人的合法权益。
实际应用：
- 如果骑电动自行车在一个路口因同一违法行为（如闯红灯）被多次抓拍，行政机关在查明事实后，应只对该违法行为进行一次处罚，而不应因多次抓拍而重复处罚。
二、不同违法行为多次抓拍的情况
多种违法行为：
- 如果骑电动自行车在一个路口存在多种违法行为（如闯红灯、逆行、未佩戴安全头盔等），且每种违法行为都被抓拍到，那么行政机关有权对每种违法行为分别进行处罚。
处罚依据：
- 每种违法行为都有其对应的法律条款和处罚标准，行政机关会根据具体违法行为和法律规定进行处罚。例如，闯红灯可能面临罚款、扣分等处罚，逆行同样可能面临相应的处罚。
三、抓拍系统的技术特点与法律适用
抓拍系统的工作原理：
- 交通抓拍系统通常通过图像识别技术来捕捉违法行为，并在短时间内连续拍摄多张照片以确认违法事实。然而，这并不意味着每次抓拍都对应一个独立的违法行为。
法律适用的关键点：
- 在判断多次抓拍是否构成多次违法时，关键在于确认每次抓拍是否对应一个独立的、不同的违法行为。如果仅因同一违法行为被多次抓拍，则不应重复处罚。
四、建议与注意事项
及时查询违法记录：
- 如果收到多次违法通知，建议及时查询违法记录，确认每次抓拍是否对应不同的违法行为。
保留证据：
- 如果对处罚有异议，可以保留相关证据（如抓拍照片、视频等），以便在申诉或行政复议时提供有力支持。
遵守交通规则：
- 最根本的解决办法是遵守交通规则，避免违法行为的发生。这样不仅可以避免处罚，还能保障自身和他人的安全。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。