结论概述：
信用卡协商分期后是否还要扣年费，这主要取决于信用卡的具体条款以及协商分期的具体内容。一般情况下，如果协商分期协议中未明确免除年费，则年费仍可能被收取。以下是对此问题的详细分析：
一、信用卡年费的基本规定
信用卡年费是银行为持卡人提供信用卡服务而收取的费用，通常根据信用卡的种类、级别以及银行政策而定。年费可能一次性收取，也可能分年收取，具体取决于银行的政策。
二、协商分期对年费的影响
协商分期协议内容：
- 在协商分期时，持卡人与银行会就分期金额、分期期限、利息及费用等条款进行协商。如果协商分期协议中明确包含了免除年费的条款，那么持卡人在协商分期期间将无需支付年费。
- 如果协商分期协议中未提及年费，或者仅提及了部分费用的减免而未包括年费，那么持卡人仍需按照信用卡的原始条款支付年费。
银行政策差异：
- 不同银行对于协商分期后年费的收取政策可能存在差异。有些银行可能在协商分期时主动免除年费，以吸引持卡人选择分期还款；而有些银行则可能坚持收取年费，作为提供信用卡服务的一部分。
三、持卡人应对策略
仔细阅读协商分期协议：
- 在签订协商分期协议前，持卡人应仔细阅读协议内容，特别是关于年费的条款。如果协议中未明确免除年费，持卡人应主动与银行沟通，争取免除或降低年费。
了解银行政策：
- 持卡人可以事先了解银行对于协商分期后年费的收取政策，以便在协商时更有针对性地提出自己的需求。
考虑其他还款方式：
- 如果协商分期后年费仍然较高，持卡人可以考虑其他还款方式，如一次性还清欠款或选择其他银行的信用卡进行分期还款，以降低年费支出。
四、法律背景与建议
- 从法律角度来看，信用卡年费是银行与持卡人之间的合同约定，双方应遵守合同条款。如果银行在协商分期后仍然收取年费，且该费用在合同中有明确约定，那么持卡人通常需要支付该费用。
- 如果持卡人认为银行收取的年费不合理或存在欺诈行为，可以向银行投诉或寻求法律援助。在此情况下，持卡人应保留好相关证据，如协商分期协议、信用卡账单等，以便在需要时提供证明。
五、特殊情况说明
- 如果持卡人因特殊原因（如重大疾病、失业等）导致无法按时支付年费，可以向银行申请减免或延期支付。银行可能会根据持卡人的实际情况给予一定的宽限期或减免部分费用。
总结与建议：
信用卡协商分期后是否还要扣年费，取决于协商分期协议的具体内容以及银行的政策。持卡人在签订协商分期协议前，应仔细阅读协议内容并了解银行政策，以避免不必要的费用支出。如果持卡人对年费有疑问或认为不合理，可以主动与银行沟通并寻求解决方案。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。