市场监管部门查扣货物后，一般会根据货物的性质、违法情节的严重程度以及相关法律法规的规定，采取以下几种处理方式：
- 依法没收：如果货物属于违法所得、违禁品或者用于违法活动的工具等，市场监管部门会依据相关法律法规的规定，对货物进行没收处理。例如，销售假冒伪劣商品，这些商品就会被依法没收。
- 拍卖或变卖：对于一些依法应当没收但仍有使用价值的货物，在经过法定程序后，市场监管部门可能会将其进行拍卖或变卖。所得款项会按照规定上缴国库。比如，没收了一批质量合格但来源不合法的电子产品，可能会通过拍卖的方式处理。
- 返还当事人：如果查扣的货物经调查核实与违法行为无关，或者属于当事人的合法财产，市场监管部门会在规定的时间内返还给当事人。例如，在调查过程中发现查扣的货物是当事人合法采购且用于正常经营的，就会及时返还。
- 销毁处理：对于一些危害人体健康、存在重大安全隐患或者严重污染环境的货物，市场监管部门会按照规定进行销毁处理。比如，没收了过期的、变质的食品，为了防止其再次流入市场危害公众健康，就会进行销毁。
在处理过程中，市场监管部门会遵循严格的法定程序：
- 首先，会制作查封、扣押决定书，并当场交付当事人，告知当事人相关的权利和义务。
- 然后，会对查扣的货物进行妥善保管，防止货物损坏、灭失。
- 在调查结束后，会根据调查结果依法作出处理决定，并及时通知当事人。
如果当事人对市场监管部门的处理决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
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