结论：别人拿走你的电动自行车合格证是否违法，需根据具体情况判断，一般可能涉及侵犯财产权或违反相关管理规定。

详细分析：

1. 从财产权角度分析：

   • 电动自行车合格证作为车辆的重要凭证，属于你的个人财产的一部分。如果别人未经你允许拿走了合格证，这可能构成对你财产权的侵犯。
   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，财产权受法律保护，任何组织或者个人不得侵犯。因此，如果别人拿走了你的合格证，你有权要求其返还，并可以视情况追究其法律责任。

2. 从管理规定角度分析：

   • 电动自行车合格证也是车辆上牌、年检等管理活动的重要依据。如果别人拿走了你的合格证，可能导致你无法正常进行这些管理活动，从而违反相关管理规定。
   • 虽然直接的法律责任可能并不明确指向拿走合格证的行为本身，但由此引发的无法上牌、年检等后果，可能会间接导致你面临交通管理部门的处罚。

3. 特殊情况考虑：

   • 如果拿走合格证的人是你的亲友，且只是暂时借用或保管，并未造成你的实际损失或困扰，那么这种情况可能不构成违法。但即便如此，你也应要求其尽快归还，以免产生不必要的麻烦。
   • 如果拿走合格证的人是为了进行非法活动，如伪造、变造车辆证件等，那么这种行为不仅违法，还可能构成犯罪。在这种情况下，你应立即向公安机关报案，并配合调查。

法律建议：

• 如果别人拿走了你的电动自行车合格证，你应首先尝试与其沟通，要求其返还。
• 如果沟通无果，或者你怀疑对方可能进行非法活动，你应立即向公安机关报案，并保留好相关证据，如聊天记录、监控录像等。
• 在日常生活中，你也应妥善保管好自己的车辆证件和相关信息，避免泄露或丢失。

后续行动指导：

• 在处理此类问题时，你可以先收集相关证据，如合格证的照片、复印件（如果有的话），以及拿走合格证的人的相关信息。
• 然后，你可以尝试与对方进行沟通，明确表达你的诉求和立场。
• 如果沟通无果，或者情况复杂，你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。